Protein–RNA interactions for Protein: P04940

Ig kappa chain V-VI region NQ2-17.4.1, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04940 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P04940 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P04940 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P04940 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P04940 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P04940 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P04940 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P04940 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P04940 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P04940 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
P04940 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P04940 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P04940 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
P04940 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P04940 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P04940 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P04940 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P04940 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P04940 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P04940 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P04940 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P04940 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P04940 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P04940 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P04940 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P04940 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P04940 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P04940 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P04940 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P04940 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P04940 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P04940 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P04940 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P04940 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P04940 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P04940 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P04940 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P04940 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P04940 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P04940 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P04940 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P04940 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P04940 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P04940 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P04940 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P04940 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P04940 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P04940 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P04940 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P04940 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P04940 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P04940 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P04940 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P04940 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
P04940 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P04940 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P04940 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P04940 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P04940 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P04940 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P04940 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
P04940 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P04940 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P04940 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
P04940 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
P04940 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
P04940 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
P04940 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P04940 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P04940 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P04940 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P04940 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P04940 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P04940 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P04940 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P04940 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P04940 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P04940 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P04940 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P04940 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P04940 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P04940 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P04940 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P04940 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P04940 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P04940 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P04940 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P04940 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P04940 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P04940 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P04940 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P04940 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P04940 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P04940 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P04940 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P04940 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P04940 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P04940 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P04940 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P04940 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms