Protein–RNA interactions for Protein: P02830

Hoxa7, Homeobox protein Hox-A7, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa7P02830 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hoxa7P02830 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hoxa7P02830 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hoxa7P02830 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Hoxa7P02830 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
Hoxa7P02830 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Hoxa7P02830 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hoxa7P02830 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hoxa7P02830 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hoxa7P02830 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Hoxa7P02830 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Hoxa7P02830 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hoxa7P02830 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hoxa7P02830 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hoxa7P02830 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hoxa7P02830 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hoxa7P02830 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hoxa7P02830 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hoxa7P02830 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hoxa7P02830 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hoxa7P02830 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hoxa7P02830 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hoxa7P02830 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hoxa7P02830 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hoxa7P02830 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hoxa7P02830 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hoxa7P02830 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hoxa7P02830 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hoxa7P02830 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hoxa7P02830 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hoxa7P02830 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hoxa7P02830 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hoxa7P02830 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hoxa7P02830 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hoxa7P02830 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hoxa7P02830 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Hoxa7P02830 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hoxa7P02830 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hoxa7P02830 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hoxa7P02830 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hoxa7P02830 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hoxa7P02830 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hoxa7P02830 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Hoxa7P02830 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hoxa7P02830 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hoxa7P02830 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hoxa7P02830 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hoxa7P02830 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hoxa7P02830 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hoxa7P02830 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hoxa7P02830 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hoxa7P02830 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hoxa7P02830 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hoxa7P02830 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hoxa7P02830 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hoxa7P02830 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hoxa7P02830 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hoxa7P02830 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hoxa7P02830 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hoxa7P02830 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hoxa7P02830 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hoxa7P02830 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hoxa7P02830 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hoxa7P02830 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Hoxa7P02830 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hoxa7P02830 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hoxa7P02830 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hoxa7P02830 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Hoxa7P02830 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Hoxa7P02830 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Hoxa7P02830 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Hoxa7P02830 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Hoxa7P02830 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Hoxa7P02830 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Hoxa7P02830 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Hoxa7P02830 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hoxa7P02830 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hoxa7P02830 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hoxa7P02830 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hoxa7P02830 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hoxa7P02830 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hoxa7P02830 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hoxa7P02830 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hoxa7P02830 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hoxa7P02830 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hoxa7P02830 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hoxa7P02830 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hoxa7P02830 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hoxa7P02830 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hoxa7P02830 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hoxa7P02830 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hoxa7P02830 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hoxa7P02830 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Hoxa7P02830 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Hoxa7P02830 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Hoxa7P02830 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Hoxa7P02830 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Hoxa7P02830 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hoxa7P02830 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hoxa7P02830 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms