Protein–RNA interactions for Protein: P01901

H2-K1, H-2 class I histocompatibility antigen, K-B alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-K1P01901 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
H2-K1P01901 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
H2-K1P01901 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
H2-K1P01901 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
H2-K1P01901 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2-K1P01901 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2-K1P01901 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2-K1P01901 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2-K1P01901 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2-K1P01901 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2-K1P01901 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2-K1P01901 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2-K1P01901 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2-K1P01901 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2-K1P01901 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2-K1P01901 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2-K1P01901 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2-K1P01901 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
H2-K1P01901 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
H2-K1P01901 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
H2-K1P01901 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
H2-K1P01901 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
H2-K1P01901 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
H2-K1P01901 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
H2-K1P01901 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
H2-K1P01901 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
H2-K1P01901 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
H2-K1P01901 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
H2-K1P01901 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
H2-K1P01901 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
H2-K1P01901 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
H2-K1P01901 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
H2-K1P01901 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2-K1P01901 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2-K1P01901 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2-K1P01901 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2-K1P01901 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2-K1P01901 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2-K1P01901 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2-K1P01901 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2-K1P01901 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2-K1P01901 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2-K1P01901 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2-K1P01901 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2-K1P01901 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2-K1P01901 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2-K1P01901 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2-K1P01901 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2-K1P01901 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2-K1P01901 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
H2-K1P01901 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2-K1P01901 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2-K1P01901 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2-K1P01901 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2-K1P01901 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2-K1P01901 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2-K1P01901 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2-K1P01901 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2-K1P01901 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2-K1P01901 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2-K1P01901 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2-K1P01901 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2-K1P01901 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2-K1P01901 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2-K1P01901 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2-K1P01901 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2-K1P01901 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2-K1P01901 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2-K1P01901 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2-K1P01901 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2-K1P01901 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2-K1P01901 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2-K1P01901 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2-K1P01901 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2-K1P01901 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2-K1P01901 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2-K1P01901 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2-K1P01901 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2-K1P01901 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2-K1P01901 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2-K1P01901 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2-K1P01901 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2-K1P01901 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2-K1P01901 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2-K1P01901 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2-K1P01901 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2-K1P01901 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2-K1P01901 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2-K1P01901 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2-K1P01901 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2-K1P01901 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2-K1P01901 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2-K1P01901 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2-K1P01901 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2-K1P01901 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2-K1P01901 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2-K1P01901 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2-K1P01901 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2-K1P01901 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2-K1P01901 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms