Protein–RNA interactions for Protein: P01887

B2m, Beta-2-microglobulin, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B2mP01887 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
B2mP01887 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
B2mP01887 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
B2mP01887 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
B2mP01887 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
B2mP01887 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
B2mP01887 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
B2mP01887 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
B2mP01887 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
B2mP01887 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
B2mP01887 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
B2mP01887 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
B2mP01887 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
B2mP01887 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
B2mP01887 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
B2mP01887 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
B2mP01887 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
B2mP01887 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
B2mP01887 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
B2mP01887 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
B2mP01887 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
B2mP01887 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
B2mP01887 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
B2mP01887 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
B2mP01887 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
B2mP01887 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
B2mP01887 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
B2mP01887 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
B2mP01887 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
B2mP01887 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
B2mP01887 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
B2mP01887 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
B2mP01887 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
B2mP01887 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
B2mP01887 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
B2mP01887 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
B2mP01887 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
B2mP01887 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
B2mP01887 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
B2mP01887 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
B2mP01887 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
B2mP01887 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
B2mP01887 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
B2mP01887 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
B2mP01887 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
B2mP01887 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
B2mP01887 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
B2mP01887 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
B2mP01887 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
B2mP01887 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
B2mP01887 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
B2mP01887 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
B2mP01887 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
B2mP01887 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
B2mP01887 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
B2mP01887 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
B2mP01887 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
B2mP01887 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
B2mP01887 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
B2mP01887 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
B2mP01887 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
B2mP01887 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
B2mP01887 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
B2mP01887 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
B2mP01887 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
B2mP01887 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
B2mP01887 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
B2mP01887 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
B2mP01887 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
B2mP01887 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
B2mP01887 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
B2mP01887 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
B2mP01887 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
B2mP01887 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
B2mP01887 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
B2mP01887 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
B2mP01887 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
B2mP01887 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
B2mP01887 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
B2mP01887 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
B2mP01887 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
B2mP01887 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
B2mP01887 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
B2mP01887 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
B2mP01887 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
B2mP01887 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
B2mP01887 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
B2mP01887 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
B2mP01887 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
B2mP01887 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
B2mP01887 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
B2mP01887 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
B2mP01887 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
B2mP01887 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
B2mP01887 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
B2mP01887 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
B2mP01887 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
B2mP01887 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
B2mP01887 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
B2mP01887 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms