Protein–RNA interactions for Protein: P01727

Ig lambda-1 chain V region S43, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01727 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01727 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01727 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01727 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01727 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01727 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01727 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01727 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01727 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01727 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01727 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
P01727 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01727 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01727 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01727 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01727 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01727 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01727 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01727 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01727 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01727 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01727 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01727 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
P01727 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
P01727 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01727 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01727 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01727 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01727 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01727 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01727 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
P01727 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01727 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01727 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
P01727 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01727 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01727 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01727 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01727 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01727 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01727 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01727 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01727 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01727 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01727 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01727 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01727 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01727 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01727 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01727 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01727 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01727 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01727 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01727 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01727 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01727 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01727 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
P01727 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01727 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01727 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01727 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01727 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
P01727 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01727 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01727 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01727 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01727 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01727 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01727 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01727 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01727 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01727 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01727 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01727 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01727 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
P01727 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01727 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01727 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01727 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01727 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01727 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01727 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01727 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01727 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01727 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
P01727 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01727 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01727 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01727 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01727 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
P01727 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01727 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01727 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01727 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01727 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01727 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01727 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01727 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01727 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01727 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms