Protein–RNA interactions for Protein: P01674

Ig kappa chain V-III region PC 2154, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01674 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01674 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01674 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01674 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01674 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01674 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01674 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01674 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01674 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01674 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01674 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01674 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01674 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01674 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01674 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01674 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01674 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01674 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01674 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01674 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01674 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01674 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01674 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01674 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01674 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01674 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01674 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01674 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01674 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01674 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01674 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01674 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01674 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01674 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01674 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01674 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01674 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01674 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01674 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01674 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01674 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01674 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
P01674 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01674 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01674 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01674 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01674 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01674 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01674 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01674 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01674 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01674 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01674 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01674 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01674 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01674 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01674 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01674 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01674 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01674 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01674 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01674 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
P01674 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01674 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01674 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01674 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01674 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01674 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01674 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
P01674 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01674 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
P01674 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01674 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01674 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01674 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01674 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01674 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01674 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01674 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01674 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01674 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01674 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01674 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01674 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01674 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01674 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01674 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01674 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01674 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P01674 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P01674 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P01674 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P01674 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P01674 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
P01674 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P01674 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P01674 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
P01674 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P01674 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P01674 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms