Protein–RNA interactions for Protein: P01643

Ig kappa chain V-V region MOPC 173, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01643 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01643 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01643 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
P01643 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01643 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01643 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
P01643 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01643 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01643 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01643 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01643 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01643 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01643 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01643 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01643 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01643 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01643 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01643 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01643 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
P01643 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01643 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01643 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01643 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
P01643 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
P01643 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01643 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01643 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01643 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01643 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01643 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01643 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01643 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01643 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01643 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01643 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01643 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01643 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01643 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01643 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01643 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01643 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
P01643 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01643 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01643 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01643 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01643 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01643 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01643 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01643 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01643 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01643 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01643 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
P01643 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01643 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01643 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01643 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01643 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01643 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01643 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01643 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01643 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01643 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01643 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01643 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01643 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01643 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01643 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01643 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01643 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01643 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01643 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01643 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01643 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01643 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
P01643 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01643 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01643 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01643 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01643 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01643 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01643 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01643 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01643 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01643 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01643 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01643 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01643 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01643 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01643 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01643 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01643 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01643 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01643 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
P01643 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
P01643 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01643 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01643 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01643 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01643 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01643 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms