Protein–RNA interactions for Protein: P01638

Ig kappa chain V-V region L6 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01638 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01638 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01638 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01638 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01638 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01638 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01638 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01638 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01638 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01638 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01638 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01638 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01638 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01638 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01638 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01638 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01638 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01638 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01638 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01638 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01638 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01638 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
P01638 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01638 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01638 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01638 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01638 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01638 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01638 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01638 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01638 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01638 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01638 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01638 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01638 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01638 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01638 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01638 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01638 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01638 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01638 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
P01638 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01638 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01638 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01638 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01638 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01638 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01638 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01638 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01638 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01638 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01638 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01638 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01638 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01638 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01638 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01638 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01638 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01638 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01638 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01638 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01638 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01638 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01638 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01638 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01638 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01638 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01638 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01638 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01638 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
P01638 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
P01638 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
P01638 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
P01638 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01638 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01638 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01638 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01638 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01638 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01638 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01638 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01638 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01638 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01638 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01638 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01638 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01638 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
P01638 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01638 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01638 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01638 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
P01638 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01638 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
P01638 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01638 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01638 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01638 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01638 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
P01638 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01638 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms