Protein–RNA interactions for Protein: P00848

Mtatp6, ATP synthase subunit a, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtatp6P00848 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Mtatp6P00848 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mtatp6P00848 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mtatp6P00848 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mtatp6P00848 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mtatp6P00848 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mtatp6P00848 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mtatp6P00848 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mtatp6P00848 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mtatp6P00848 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mtatp6P00848 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mtatp6P00848 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mtatp6P00848 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mtatp6P00848 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Mtatp6P00848 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mtatp6P00848 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mtatp6P00848 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mtatp6P00848 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mtatp6P00848 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mtatp6P00848 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mtatp6P00848 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mtatp6P00848 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mtatp6P00848 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mtatp6P00848 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mtatp6P00848 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mtatp6P00848 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mtatp6P00848 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mtatp6P00848 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mtatp6P00848 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mtatp6P00848 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mtatp6P00848 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mtatp6P00848 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mtatp6P00848 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mtatp6P00848 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mtatp6P00848 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Mtatp6P00848 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mtatp6P00848 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mtatp6P00848 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mtatp6P00848 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mtatp6P00848 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mtatp6P00848 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mtatp6P00848 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mtatp6P00848 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mtatp6P00848 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mtatp6P00848 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Mtatp6P00848 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mtatp6P00848 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mtatp6P00848 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mtatp6P00848 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mtatp6P00848 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mtatp6P00848 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mtatp6P00848 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mtatp6P00848 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mtatp6P00848 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mtatp6P00848 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Mtatp6P00848 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mtatp6P00848 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mtatp6P00848 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mtatp6P00848 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mtatp6P00848 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mtatp6P00848 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mtatp6P00848 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mtatp6P00848 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mtatp6P00848 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mtatp6P00848 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mtatp6P00848 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mtatp6P00848 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mtatp6P00848 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mtatp6P00848 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mtatp6P00848 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Mtatp6P00848 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mtatp6P00848 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mtatp6P00848 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mtatp6P00848 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mtatp6P00848 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mtatp6P00848 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mtatp6P00848 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mtatp6P00848 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mtatp6P00848 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mtatp6P00848 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mtatp6P00848 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mtatp6P00848 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mtatp6P00848 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mtatp6P00848 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mtatp6P00848 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mtatp6P00848 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mtatp6P00848 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mtatp6P00848 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Mtatp6P00848 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mtatp6P00848 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mtatp6P00848 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mtatp6P00848 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mtatp6P00848 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mtatp6P00848 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mtatp6P00848 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mtatp6P00848 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mtatp6P00848 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mtatp6P00848 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mtatp6P00848 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mtatp6P00848 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms