Protein–RNA interactions for Protein: P00520

Abl1, Tyrosine-protein kinase ABL1, mousemouse

Predictions only

Length 1,123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abl1P00520 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Abl1P00520 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Abl1P00520 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Abl1P00520 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Abl1P00520 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Abl1P00520 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Abl1P00520 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Abl1P00520 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Abl1P00520 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Abl1P00520 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Abl1P00520 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Abl1P00520 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Abl1P00520 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Abl1P00520 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Abl1P00520 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Abl1P00520 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Abl1P00520 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Abl1P00520 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Abl1P00520 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Abl1P00520 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Abl1P00520 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Abl1P00520 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Abl1P00520 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Abl1P00520 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Abl1P00520 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Abl1P00520 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Abl1P00520 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Abl1P00520 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Abl1P00520 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Abl1P00520 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Abl1P00520 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Abl1P00520 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Abl1P00520 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Abl1P00520 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Abl1P00520 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Abl1P00520 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Abl1P00520 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Abl1P00520 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Abl1P00520 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Abl1P00520 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Abl1P00520 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Abl1P00520 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Abl1P00520 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Abl1P00520 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Abl1P00520 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Abl1P00520 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Abl1P00520 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Abl1P00520 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Abl1P00520 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Abl1P00520 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Abl1P00520 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Abl1P00520 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Abl1P00520 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Abl1P00520 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Abl1P00520 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Abl1P00520 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Abl1P00520 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Abl1P00520 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Abl1P00520 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Abl1P00520 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Abl1P00520 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Abl1P00520 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Abl1P00520 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Abl1P00520 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Abl1P00520 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Abl1P00520 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Abl1P00520 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Abl1P00520 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Abl1P00520 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Abl1P00520 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Abl1P00520 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Abl1P00520 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Abl1P00520 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Abl1P00520 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Abl1P00520 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Abl1P00520 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Abl1P00520 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Abl1P00520 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Abl1P00520 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Abl1P00520 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Abl1P00520 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Abl1P00520 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Abl1P00520 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Abl1P00520 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Abl1P00520 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Abl1P00520 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Abl1P00520 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Abl1P00520 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Abl1P00520 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Abl1P00520 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Abl1P00520 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Abl1P00520 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Abl1P00520 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Abl1P00520 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Abl1P00520 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Abl1P00520 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Abl1P00520 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Abl1P00520 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Abl1P00520 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Abl1P00520 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms