Protein–RNA interactions for Protein: O88974

Setdb1, Histone-lysine N-methyltransferase SETDB1, mousemouse

Predictions only

Length 1,307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setdb1O88974 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Setdb1O88974 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Setdb1O88974 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Setdb1O88974 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Setdb1O88974 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Setdb1O88974 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Setdb1O88974 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Setdb1O88974 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Setdb1O88974 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Setdb1O88974 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Setdb1O88974 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Setdb1O88974 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Setdb1O88974 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Setdb1O88974 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Setdb1O88974 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Setdb1O88974 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Setdb1O88974 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Setdb1O88974 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Setdb1O88974 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Setdb1O88974 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Setdb1O88974 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Setdb1O88974 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Setdb1O88974 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Setdb1O88974 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Setdb1O88974 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Setdb1O88974 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Setdb1O88974 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Setdb1O88974 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Setdb1O88974 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Setdb1O88974 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Setdb1O88974 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Setdb1O88974 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Setdb1O88974 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Setdb1O88974 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Setdb1O88974 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Setdb1O88974 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Setdb1O88974 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Setdb1O88974 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Setdb1O88974 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Setdb1O88974 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Setdb1O88974 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Setdb1O88974 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Setdb1O88974 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Setdb1O88974 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Setdb1O88974 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Setdb1O88974 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Setdb1O88974 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Setdb1O88974 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Setdb1O88974 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Setdb1O88974 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Setdb1O88974 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Setdb1O88974 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Setdb1O88974 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Setdb1O88974 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Setdb1O88974 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Setdb1O88974 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Setdb1O88974 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Setdb1O88974 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Setdb1O88974 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Setdb1O88974 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Setdb1O88974 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Setdb1O88974 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Setdb1O88974 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Setdb1O88974 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Setdb1O88974 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Setdb1O88974 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Setdb1O88974 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Setdb1O88974 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Setdb1O88974 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Setdb1O88974 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Setdb1O88974 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Setdb1O88974 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Setdb1O88974 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Setdb1O88974 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Setdb1O88974 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Setdb1O88974 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Setdb1O88974 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Setdb1O88974 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Setdb1O88974 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Setdb1O88974 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Setdb1O88974 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Setdb1O88974 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Setdb1O88974 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Setdb1O88974 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Setdb1O88974 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Setdb1O88974 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Setdb1O88974 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Setdb1O88974 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Setdb1O88974 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Setdb1O88974 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Setdb1O88974 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Setdb1O88974 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Setdb1O88974 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Setdb1O88974 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Setdb1O88974 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Setdb1O88974 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Setdb1O88974 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Setdb1O88974 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Setdb1O88974 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Setdb1O88974 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67 ms