Protein–RNA interactions for Protein: O88507

Cntfr, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntfrO88507 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CntfrO88507 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CntfrO88507 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CntfrO88507 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CntfrO88507 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CntfrO88507 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CntfrO88507 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CntfrO88507 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CntfrO88507 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CntfrO88507 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CntfrO88507 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CntfrO88507 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CntfrO88507 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CntfrO88507 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CntfrO88507 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CntfrO88507 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CntfrO88507 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CntfrO88507 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CntfrO88507 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CntfrO88507 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CntfrO88507 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CntfrO88507 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CntfrO88507 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CntfrO88507 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CntfrO88507 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CntfrO88507 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CntfrO88507 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CntfrO88507 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CntfrO88507 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CntfrO88507 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CntfrO88507 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CntfrO88507 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CntfrO88507 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CntfrO88507 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CntfrO88507 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CntfrO88507 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CntfrO88507 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CntfrO88507 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CntfrO88507 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CntfrO88507 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CntfrO88507 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CntfrO88507 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CntfrO88507 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
CntfrO88507 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CntfrO88507 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CntfrO88507 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CntfrO88507 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CntfrO88507 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CntfrO88507 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CntfrO88507 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CntfrO88507 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CntfrO88507 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CntfrO88507 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CntfrO88507 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CntfrO88507 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CntfrO88507 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CntfrO88507 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CntfrO88507 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CntfrO88507 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CntfrO88507 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CntfrO88507 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CntfrO88507 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CntfrO88507 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CntfrO88507 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CntfrO88507 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CntfrO88507 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CntfrO88507 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CntfrO88507 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CntfrO88507 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CntfrO88507 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CntfrO88507 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CntfrO88507 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CntfrO88507 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CntfrO88507 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CntfrO88507 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CntfrO88507 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CntfrO88507 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CntfrO88507 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CntfrO88507 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CntfrO88507 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CntfrO88507 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CntfrO88507 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CntfrO88507 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CntfrO88507 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CntfrO88507 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CntfrO88507 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CntfrO88507 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CntfrO88507 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CntfrO88507 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CntfrO88507 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CntfrO88507 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CntfrO88507 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CntfrO88507 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CntfrO88507 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CntfrO88507 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CntfrO88507 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CntfrO88507 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CntfrO88507 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CntfrO88507 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CntfrO88507 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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