Protein–RNA interactions for Protein: O88346

Tnnt1, Troponin T, slow skeletal muscle, mousemouse

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Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt1O88346 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tnnt1O88346 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tnnt1O88346 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tnnt1O88346 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tnnt1O88346 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tnnt1O88346 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Tnnt1O88346 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tnnt1O88346 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tnnt1O88346 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tnnt1O88346 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tnnt1O88346 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tnnt1O88346 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tnnt1O88346 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tnnt1O88346 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tnnt1O88346 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tnnt1O88346 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tnnt1O88346 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tnnt1O88346 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tnnt1O88346 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tnnt1O88346 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tnnt1O88346 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tnnt1O88346 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tnnt1O88346 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tnnt1O88346 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tnnt1O88346 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tnnt1O88346 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tnnt1O88346 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tnnt1O88346 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tnnt1O88346 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tnnt1O88346 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tnnt1O88346 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tnnt1O88346 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tnnt1O88346 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tnnt1O88346 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tnnt1O88346 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tnnt1O88346 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Tnnt1O88346 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tnnt1O88346 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tnnt1O88346 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tnnt1O88346 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Tnnt1O88346 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tnnt1O88346 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tnnt1O88346 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tnnt1O88346 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tnnt1O88346 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tnnt1O88346 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tnnt1O88346 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Tnnt1O88346 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tnnt1O88346 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tnnt1O88346 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tnnt1O88346 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tnnt1O88346 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Tnnt1O88346 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Tnnt1O88346 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Tnnt1O88346 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tnnt1O88346 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tnnt1O88346 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tnnt1O88346 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tnnt1O88346 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tnnt1O88346 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tnnt1O88346 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tnnt1O88346 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tnnt1O88346 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tnnt1O88346 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tnnt1O88346 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tnnt1O88346 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tnnt1O88346 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tnnt1O88346 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tnnt1O88346 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tnnt1O88346 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Tnnt1O88346 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tnnt1O88346 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tnnt1O88346 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tnnt1O88346 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Tnnt1O88346 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tnnt1O88346 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tnnt1O88346 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tnnt1O88346 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tnnt1O88346 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tnnt1O88346 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tnnt1O88346 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tnnt1O88346 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tnnt1O88346 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tnnt1O88346 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tnnt1O88346 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tnnt1O88346 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tnnt1O88346 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tnnt1O88346 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tnnt1O88346 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Tnnt1O88346 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tnnt1O88346 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tnnt1O88346 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tnnt1O88346 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Tnnt1O88346 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Tnnt1O88346 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tnnt1O88346 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tnnt1O88346 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tnnt1O88346 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tnnt1O88346 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tnnt1O88346 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
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