Protein–RNA interactions for Protein: O70589

Cask, Peripheral plasma membrane protein CASK, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CaskO70589 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CaskO70589 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CaskO70589 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CaskO70589 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CaskO70589 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CaskO70589 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CaskO70589 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CaskO70589 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CaskO70589 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CaskO70589 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CaskO70589 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CaskO70589 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CaskO70589 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CaskO70589 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CaskO70589 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CaskO70589 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CaskO70589 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CaskO70589 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CaskO70589 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CaskO70589 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CaskO70589 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CaskO70589 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CaskO70589 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CaskO70589 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CaskO70589 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CaskO70589 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CaskO70589 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CaskO70589 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CaskO70589 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CaskO70589 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CaskO70589 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CaskO70589 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CaskO70589 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CaskO70589 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CaskO70589 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CaskO70589 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CaskO70589 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CaskO70589 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CaskO70589 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CaskO70589 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CaskO70589 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CaskO70589 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CaskO70589 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CaskO70589 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CaskO70589 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CaskO70589 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CaskO70589 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CaskO70589 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CaskO70589 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CaskO70589 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CaskO70589 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CaskO70589 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CaskO70589 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CaskO70589 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CaskO70589 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CaskO70589 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CaskO70589 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CaskO70589 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CaskO70589 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CaskO70589 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
CaskO70589 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CaskO70589 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CaskO70589 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CaskO70589 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CaskO70589 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CaskO70589 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CaskO70589 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CaskO70589 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CaskO70589 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CaskO70589 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CaskO70589 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CaskO70589 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CaskO70589 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CaskO70589 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CaskO70589 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CaskO70589 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CaskO70589 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CaskO70589 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CaskO70589 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CaskO70589 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CaskO70589 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CaskO70589 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CaskO70589 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CaskO70589 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CaskO70589 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CaskO70589 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CaskO70589 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CaskO70589 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CaskO70589 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CaskO70589 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CaskO70589 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CaskO70589 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CaskO70589 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CaskO70589 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CaskO70589 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CaskO70589 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CaskO70589 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CaskO70589 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CaskO70589 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CaskO70589 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms