Protein–RNA interactions for Protein: O70491

Stra6, Receptor for retinol uptake STRA6, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stra6O70491 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Stra6O70491 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Stra6O70491 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Stra6O70491 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Stra6O70491 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Stra6O70491 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Stra6O70491 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Stra6O70491 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Stra6O70491 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Stra6O70491 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Stra6O70491 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Stra6O70491 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Stra6O70491 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Stra6O70491 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Stra6O70491 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Stra6O70491 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Stra6O70491 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Stra6O70491 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Stra6O70491 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Stra6O70491 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Stra6O70491 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Stra6O70491 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Stra6O70491 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Stra6O70491 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Stra6O70491 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Stra6O70491 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Stra6O70491 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Stra6O70491 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Stra6O70491 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Stra6O70491 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Stra6O70491 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Stra6O70491 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Stra6O70491 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Stra6O70491 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Stra6O70491 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Stra6O70491 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Stra6O70491 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Stra6O70491 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Stra6O70491 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Stra6O70491 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Stra6O70491 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Stra6O70491 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Stra6O70491 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Stra6O70491 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Stra6O70491 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Stra6O70491 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Stra6O70491 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Stra6O70491 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Stra6O70491 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Stra6O70491 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Stra6O70491 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Stra6O70491 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Stra6O70491 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Stra6O70491 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Stra6O70491 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Stra6O70491 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Stra6O70491 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Stra6O70491 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Stra6O70491 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Stra6O70491 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Stra6O70491 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Stra6O70491 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Stra6O70491 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Stra6O70491 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Stra6O70491 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Stra6O70491 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Stra6O70491 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Stra6O70491 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Stra6O70491 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Stra6O70491 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Stra6O70491 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Stra6O70491 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Stra6O70491 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Stra6O70491 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Stra6O70491 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Stra6O70491 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Stra6O70491 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Stra6O70491 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Stra6O70491 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Stra6O70491 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Stra6O70491 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Stra6O70491 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Stra6O70491 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Stra6O70491 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Stra6O70491 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Stra6O70491 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Stra6O70491 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Stra6O70491 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Stra6O70491 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Stra6O70491 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Stra6O70491 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Stra6O70491 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Stra6O70491 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Stra6O70491 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Stra6O70491 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Stra6O70491 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Stra6O70491 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Stra6O70491 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Stra6O70491 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Stra6O70491 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms