Protein–RNA interactions for Protein: O70218

Hmx1, Homeobox protein HMX1, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmx1O70218 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hmx1O70218 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hmx1O70218 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hmx1O70218 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hmx1O70218 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hmx1O70218 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hmx1O70218 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hmx1O70218 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hmx1O70218 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Hmx1O70218 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hmx1O70218 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hmx1O70218 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hmx1O70218 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hmx1O70218 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hmx1O70218 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hmx1O70218 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hmx1O70218 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hmx1O70218 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Hmx1O70218 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hmx1O70218 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hmx1O70218 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hmx1O70218 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hmx1O70218 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hmx1O70218 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hmx1O70218 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hmx1O70218 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hmx1O70218 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hmx1O70218 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hmx1O70218 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hmx1O70218 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hmx1O70218 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Hmx1O70218 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Hmx1O70218 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Hmx1O70218 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hmx1O70218 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hmx1O70218 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hmx1O70218 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hmx1O70218 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hmx1O70218 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hmx1O70218 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hmx1O70218 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hmx1O70218 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hmx1O70218 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hmx1O70218 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hmx1O70218 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Hmx1O70218 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hmx1O70218 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hmx1O70218 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hmx1O70218 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hmx1O70218 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hmx1O70218 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Hmx1O70218 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hmx1O70218 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hmx1O70218 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hmx1O70218 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hmx1O70218 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hmx1O70218 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hmx1O70218 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hmx1O70218 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hmx1O70218 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hmx1O70218 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hmx1O70218 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hmx1O70218 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hmx1O70218 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hmx1O70218 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hmx1O70218 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hmx1O70218 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hmx1O70218 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hmx1O70218 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hmx1O70218 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hmx1O70218 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Hmx1O70218 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hmx1O70218 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hmx1O70218 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hmx1O70218 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hmx1O70218 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hmx1O70218 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hmx1O70218 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hmx1O70218 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hmx1O70218 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hmx1O70218 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hmx1O70218 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hmx1O70218 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hmx1O70218 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hmx1O70218 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hmx1O70218 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hmx1O70218 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hmx1O70218 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hmx1O70218 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hmx1O70218 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Hmx1O70218 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Hmx1O70218 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hmx1O70218 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hmx1O70218 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Hmx1O70218 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hmx1O70218 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hmx1O70218 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hmx1O70218 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hmx1O70218 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hmx1O70218 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms