Protein–RNA interactions for Protein: O55237

Cd70, CD70 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd70O55237 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cd70O55237 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cd70O55237 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cd70O55237 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cd70O55237 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cd70O55237 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cd70O55237 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cd70O55237 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cd70O55237 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Cd70O55237 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Cd70O55237 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cd70O55237 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cd70O55237 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cd70O55237 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cd70O55237 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cd70O55237 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cd70O55237 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cd70O55237 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cd70O55237 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cd70O55237 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Cd70O55237 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cd70O55237 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cd70O55237 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cd70O55237 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cd70O55237 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cd70O55237 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cd70O55237 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cd70O55237 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cd70O55237 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cd70O55237 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cd70O55237 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cd70O55237 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Cd70O55237 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cd70O55237 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cd70O55237 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cd70O55237 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cd70O55237 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cd70O55237 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cd70O55237 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cd70O55237 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cd70O55237 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cd70O55237 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cd70O55237 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cd70O55237 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cd70O55237 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cd70O55237 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cd70O55237 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cd70O55237 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cd70O55237 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cd70O55237 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cd70O55237 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cd70O55237 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cd70O55237 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cd70O55237 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cd70O55237 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cd70O55237 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cd70O55237 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cd70O55237 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cd70O55237 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Cd70O55237 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cd70O55237 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cd70O55237 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cd70O55237 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cd70O55237 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cd70O55237 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cd70O55237 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Cd70O55237 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cd70O55237 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cd70O55237 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cd70O55237 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cd70O55237 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cd70O55237 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cd70O55237 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cd70O55237 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cd70O55237 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cd70O55237 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cd70O55237 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cd70O55237 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Cd70O55237 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cd70O55237 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cd70O55237 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cd70O55237 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cd70O55237 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cd70O55237 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cd70O55237 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cd70O55237 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cd70O55237 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cd70O55237 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cd70O55237 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cd70O55237 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cd70O55237 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cd70O55237 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cd70O55237 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cd70O55237 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cd70O55237 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cd70O55237 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cd70O55237 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cd70O55237 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cd70O55237 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cd70O55237 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms