Protein–RNA interactions for Protein: O55127

Cyp26a1, Cytochrome P450 26A1, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp26a1O55127 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cyp26a1O55127 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Cyp26a1O55127 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cyp26a1O55127 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cyp26a1O55127 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cyp26a1O55127 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cyp26a1O55127 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cyp26a1O55127 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cyp26a1O55127 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cyp26a1O55127 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Cyp26a1O55127 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cyp26a1O55127 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cyp26a1O55127 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Cyp26a1O55127 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cyp26a1O55127 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cyp26a1O55127 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Cyp26a1O55127 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cyp26a1O55127 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cyp26a1O55127 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cyp26a1O55127 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cyp26a1O55127 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Cyp26a1O55127 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cyp26a1O55127 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cyp26a1O55127 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cyp26a1O55127 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cyp26a1O55127 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cyp26a1O55127 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cyp26a1O55127 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Cyp26a1O55127 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cyp26a1O55127 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cyp26a1O55127 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Cyp26a1O55127 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cyp26a1O55127 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Cyp26a1O55127 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cyp26a1O55127 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cyp26a1O55127 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cyp26a1O55127 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Cyp26a1O55127 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cyp26a1O55127 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cyp26a1O55127 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cyp26a1O55127 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cyp26a1O55127 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cyp26a1O55127 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cyp26a1O55127 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cyp26a1O55127 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cyp26a1O55127 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cyp26a1O55127 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Cyp26a1O55127 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cyp26a1O55127 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cyp26a1O55127 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cyp26a1O55127 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cyp26a1O55127 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cyp26a1O55127 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cyp26a1O55127 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Cyp26a1O55127 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cyp26a1O55127 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cyp26a1O55127 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cyp26a1O55127 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cyp26a1O55127 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cyp26a1O55127 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cyp26a1O55127 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cyp26a1O55127 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cyp26a1O55127 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cyp26a1O55127 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cyp26a1O55127 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cyp26a1O55127 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cyp26a1O55127 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cyp26a1O55127 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cyp26a1O55127 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cyp26a1O55127 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cyp26a1O55127 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cyp26a1O55127 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cyp26a1O55127 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cyp26a1O55127 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cyp26a1O55127 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cyp26a1O55127 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cyp26a1O55127 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cyp26a1O55127 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cyp26a1O55127 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cyp26a1O55127 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cyp26a1O55127 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Cyp26a1O55127 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cyp26a1O55127 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cyp26a1O55127 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cyp26a1O55127 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cyp26a1O55127 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cyp26a1O55127 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cyp26a1O55127 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cyp26a1O55127 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cyp26a1O55127 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cyp26a1O55127 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cyp26a1O55127 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Cyp26a1O55127 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Cyp26a1O55127 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cyp26a1O55127 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cyp26a1O55127 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cyp26a1O55127 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cyp26a1O55127 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cyp26a1O55127 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cyp26a1O55127 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms