Protein–RNA interactions for Protein: O55003

Bnip3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bnip3O55003 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Bnip3O55003 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Bnip3O55003 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Bnip3O55003 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Bnip3O55003 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Bnip3O55003 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Bnip3O55003 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Bnip3O55003 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Bnip3O55003 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Bnip3O55003 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Bnip3O55003 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Bnip3O55003 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Bnip3O55003 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Bnip3O55003 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Bnip3O55003 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Bnip3O55003 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Bnip3O55003 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Bnip3O55003 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Bnip3O55003 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Bnip3O55003 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Bnip3O55003 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Bnip3O55003 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Bnip3O55003 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Bnip3O55003 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Bnip3O55003 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Bnip3O55003 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Bnip3O55003 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Bnip3O55003 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Bnip3O55003 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Bnip3O55003 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Bnip3O55003 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Bnip3O55003 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Bnip3O55003 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Bnip3O55003 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Bnip3O55003 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Bnip3O55003 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Bnip3O55003 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Bnip3O55003 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Bnip3O55003 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Bnip3O55003 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Bnip3O55003 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Bnip3O55003 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Bnip3O55003 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Bnip3O55003 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Bnip3O55003 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Bnip3O55003 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Bnip3O55003 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Bnip3O55003 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Bnip3O55003 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Bnip3O55003 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Bnip3O55003 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Bnip3O55003 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Bnip3O55003 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Bnip3O55003 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Bnip3O55003 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Bnip3O55003 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Bnip3O55003 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Bnip3O55003 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Bnip3O55003 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Bnip3O55003 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Bnip3O55003 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Bnip3O55003 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Bnip3O55003 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Bnip3O55003 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Bnip3O55003 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Bnip3O55003 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Bnip3O55003 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Bnip3O55003 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Bnip3O55003 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Bnip3O55003 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Bnip3O55003 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Bnip3O55003 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Bnip3O55003 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Bnip3O55003 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Bnip3O55003 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Bnip3O55003 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Bnip3O55003 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Bnip3O55003 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Bnip3O55003 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Bnip3O55003 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Bnip3O55003 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Bnip3O55003 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Bnip3O55003 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Bnip3O55003 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Bnip3O55003 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Bnip3O55003 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Bnip3O55003 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Bnip3O55003 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Bnip3O55003 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Bnip3O55003 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Bnip3O55003 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Bnip3O55003 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Bnip3O55003 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Bnip3O55003 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Bnip3O55003 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Bnip3O55003 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Bnip3O55003 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Bnip3O55003 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Bnip3O55003 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Bnip3O55003 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms