Protein–RNA interactions for Protein: O54949

Nlk, Serine/threonine-protein kinase NLK, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NlkO54949 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NlkO54949 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NlkO54949 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NlkO54949 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NlkO54949 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NlkO54949 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NlkO54949 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NlkO54949 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NlkO54949 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NlkO54949 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NlkO54949 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NlkO54949 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NlkO54949 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NlkO54949 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
NlkO54949 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NlkO54949 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NlkO54949 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NlkO54949 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NlkO54949 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NlkO54949 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NlkO54949 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NlkO54949 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NlkO54949 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NlkO54949 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NlkO54949 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NlkO54949 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NlkO54949 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NlkO54949 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
NlkO54949 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NlkO54949 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NlkO54949 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NlkO54949 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NlkO54949 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NlkO54949 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NlkO54949 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NlkO54949 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NlkO54949 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NlkO54949 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NlkO54949 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NlkO54949 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NlkO54949 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NlkO54949 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NlkO54949 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NlkO54949 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NlkO54949 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NlkO54949 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NlkO54949 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NlkO54949 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NlkO54949 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NlkO54949 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NlkO54949 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NlkO54949 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NlkO54949 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NlkO54949 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NlkO54949 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NlkO54949 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NlkO54949 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NlkO54949 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NlkO54949 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NlkO54949 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NlkO54949 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NlkO54949 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NlkO54949 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
NlkO54949 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NlkO54949 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NlkO54949 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NlkO54949 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NlkO54949 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NlkO54949 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NlkO54949 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NlkO54949 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NlkO54949 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NlkO54949 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NlkO54949 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NlkO54949 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NlkO54949 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NlkO54949 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NlkO54949 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NlkO54949 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NlkO54949 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NlkO54949 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NlkO54949 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NlkO54949 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NlkO54949 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NlkO54949 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NlkO54949 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NlkO54949 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NlkO54949 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NlkO54949 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
NlkO54949 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NlkO54949 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NlkO54949 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NlkO54949 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NlkO54949 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NlkO54949 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NlkO54949 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NlkO54949 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NlkO54949 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NlkO54949 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NlkO54949 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms