Protein–RNA interactions for Protein: O54946

Dnajb6, DnaJ homolog subfamily B member 6, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajb6O54946 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Dnajb6O54946 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Dnajb6O54946 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Dnajb6O54946 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Dnajb6O54946 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Dnajb6O54946 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Dnajb6O54946 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Dnajb6O54946 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Dnajb6O54946 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Dnajb6O54946 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Dnajb6O54946 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Dnajb6O54946 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Dnajb6O54946 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Dnajb6O54946 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Dnajb6O54946 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Dnajb6O54946 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Dnajb6O54946 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Dnajb6O54946 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Dnajb6O54946 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Dnajb6O54946 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Dnajb6O54946 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Dnajb6O54946 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Dnajb6O54946 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Dnajb6O54946 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Dnajb6O54946 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Dnajb6O54946 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Dnajb6O54946 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Dnajb6O54946 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Dnajb6O54946 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Dnajb6O54946 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Dnajb6O54946 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Dnajb6O54946 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Dnajb6O54946 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Dnajb6O54946 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Dnajb6O54946 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Dnajb6O54946 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Dnajb6O54946 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Dnajb6O54946 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Dnajb6O54946 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Dnajb6O54946 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Dnajb6O54946 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Dnajb6O54946 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Dnajb6O54946 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Dnajb6O54946 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Dnajb6O54946 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Dnajb6O54946 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Dnajb6O54946 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Dnajb6O54946 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Dnajb6O54946 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Dnajb6O54946 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Dnajb6O54946 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Dnajb6O54946 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Dnajb6O54946 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Dnajb6O54946 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Dnajb6O54946 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Dnajb6O54946 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Dnajb6O54946 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Dnajb6O54946 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Dnajb6O54946 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Dnajb6O54946 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Dnajb6O54946 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Dnajb6O54946 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Dnajb6O54946 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Dnajb6O54946 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Dnajb6O54946 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Dnajb6O54946 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Dnajb6O54946 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Dnajb6O54946 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Dnajb6O54946 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Dnajb6O54946 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Dnajb6O54946 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Dnajb6O54946 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Dnajb6O54946 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Dnajb6O54946 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Dnajb6O54946 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Dnajb6O54946 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Dnajb6O54946 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Dnajb6O54946 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Dnajb6O54946 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Dnajb6O54946 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Dnajb6O54946 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Dnajb6O54946 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Dnajb6O54946 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Dnajb6O54946 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Dnajb6O54946 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Dnajb6O54946 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Dnajb6O54946 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Dnajb6O54946 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Dnajb6O54946 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Dnajb6O54946 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Dnajb6O54946 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Dnajb6O54946 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Dnajb6O54946 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Dnajb6O54946 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Dnajb6O54946 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Dnajb6O54946 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Dnajb6O54946 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Dnajb6O54946 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Dnajb6O54946 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Dnajb6O54946 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms