Protein–RNA interactions for Protein: O54909

Rdh16, Cis-retinol androgen dehydrogenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16O54909 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rdh16O54909 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rdh16O54909 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Rdh16O54909 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rdh16O54909 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rdh16O54909 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rdh16O54909 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rdh16O54909 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rdh16O54909 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Rdh16O54909 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rdh16O54909 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rdh16O54909 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rdh16O54909 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rdh16O54909 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rdh16O54909 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rdh16O54909 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rdh16O54909 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rdh16O54909 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rdh16O54909 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rdh16O54909 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rdh16O54909 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rdh16O54909 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rdh16O54909 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rdh16O54909 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rdh16O54909 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rdh16O54909 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rdh16O54909 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rdh16O54909 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rdh16O54909 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rdh16O54909 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rdh16O54909 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rdh16O54909 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rdh16O54909 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rdh16O54909 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rdh16O54909 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rdh16O54909 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rdh16O54909 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rdh16O54909 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rdh16O54909 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rdh16O54909 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rdh16O54909 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rdh16O54909 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rdh16O54909 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rdh16O54909 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rdh16O54909 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rdh16O54909 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rdh16O54909 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rdh16O54909 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rdh16O54909 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rdh16O54909 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rdh16O54909 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rdh16O54909 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rdh16O54909 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rdh16O54909 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rdh16O54909 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rdh16O54909 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rdh16O54909 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rdh16O54909 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rdh16O54909 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rdh16O54909 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rdh16O54909 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rdh16O54909 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rdh16O54909 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rdh16O54909 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rdh16O54909 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rdh16O54909 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rdh16O54909 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rdh16O54909 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rdh16O54909 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rdh16O54909 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rdh16O54909 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rdh16O54909 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rdh16O54909 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rdh16O54909 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rdh16O54909 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rdh16O54909 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rdh16O54909 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rdh16O54909 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rdh16O54909 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rdh16O54909 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rdh16O54909 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rdh16O54909 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rdh16O54909 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rdh16O54909 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rdh16O54909 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rdh16O54909 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rdh16O54909 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rdh16O54909 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rdh16O54909 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rdh16O54909 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rdh16O54909 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rdh16O54909 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rdh16O54909 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rdh16O54909 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rdh16O54909 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rdh16O54909 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rdh16O54909 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rdh16O54909 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rdh16O54909 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rdh16O54909 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms