Protein–RNA interactions for Protein: O54827

Atp10a, Probable phospholipid-transporting ATPase VA, mousemouse

Predictions only

Length 1,508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp10aO54827 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Atp10aO54827 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Atp10aO54827 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Atp10aO54827 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Atp10aO54827 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Atp10aO54827 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Atp10aO54827 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
Atp10aO54827 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Atp10aO54827 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Atp10aO54827 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Atp10aO54827 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Atp10aO54827 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Atp10aO54827 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Atp10aO54827 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Atp10aO54827 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Atp10aO54827 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Atp10aO54827 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Atp10aO54827 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Atp10aO54827 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Atp10aO54827 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Atp10aO54827 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Atp10aO54827 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
Atp10aO54827 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Atp10aO54827 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Atp10aO54827 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Atp10aO54827 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Atp10aO54827 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Atp10aO54827 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Atp10aO54827 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
Atp10aO54827 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Atp10aO54827 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Atp10aO54827 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Atp10aO54827 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Atp10aO54827 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Atp10aO54827 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Atp10aO54827 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Atp10aO54827 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Atp10aO54827 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Atp10aO54827 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Atp10aO54827 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Atp10aO54827 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Atp10aO54827 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Atp10aO54827 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Atp10aO54827 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Atp10aO54827 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Atp10aO54827 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Atp10aO54827 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Atp10aO54827 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Atp10aO54827 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Atp10aO54827 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Atp10aO54827 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Atp10aO54827 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Atp10aO54827 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Atp10aO54827 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Atp10aO54827 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Atp10aO54827 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
Atp10aO54827 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Atp10aO54827 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
Atp10aO54827 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Atp10aO54827 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Atp10aO54827 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Atp10aO54827 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Atp10aO54827 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Atp10aO54827 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Atp10aO54827 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Atp10aO54827 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Atp10aO54827 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Atp10aO54827 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Atp10aO54827 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Atp10aO54827 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Atp10aO54827 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Atp10aO54827 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Atp10aO54827 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Atp10aO54827 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Atp10aO54827 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Atp10aO54827 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
Atp10aO54827 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Atp10aO54827 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Atp10aO54827 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Atp10aO54827 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Atp10aO54827 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Atp10aO54827 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Atp10aO54827 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Atp10aO54827 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Atp10aO54827 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Atp10aO54827 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Atp10aO54827 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Atp10aO54827 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Atp10aO54827 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Atp10aO54827 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Atp10aO54827 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Atp10aO54827 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Atp10aO54827 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Atp10aO54827 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Atp10aO54827 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Atp10aO54827 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Atp10aO54827 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Atp10aO54827 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Atp10aO54827 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Atp10aO54827 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms