Protein–RNA interactions for Protein: O35954

Pitpnm1, Membrane-associated phosphatidylinositol transfer protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitpnm1O35954 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pitpnm1O35954 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pitpnm1O35954 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Pitpnm1O35954 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pitpnm1O35954 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pitpnm1O35954 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pitpnm1O35954 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pitpnm1O35954 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pitpnm1O35954 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Pitpnm1O35954 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pitpnm1O35954 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pitpnm1O35954 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pitpnm1O35954 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pitpnm1O35954 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pitpnm1O35954 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pitpnm1O35954 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pitpnm1O35954 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pitpnm1O35954 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pitpnm1O35954 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pitpnm1O35954 Mrgpra4-201ENSMUST00000087092 1259 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pitpnm1O35954 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pitpnm1O35954 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pitpnm1O35954 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pitpnm1O35954 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pitpnm1O35954 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pitpnm1O35954 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pitpnm1O35954 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pitpnm1O35954 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pitpnm1O35954 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pitpnm1O35954 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pitpnm1O35954 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pitpnm1O35954 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pitpnm1O35954 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pitpnm1O35954 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Pitpnm1O35954 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pitpnm1O35954 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pitpnm1O35954 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pitpnm1O35954 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Pitpnm1O35954 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pitpnm1O35954 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pitpnm1O35954 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pitpnm1O35954 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pitpnm1O35954 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pitpnm1O35954 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pitpnm1O35954 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pitpnm1O35954 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Pitpnm1O35954 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pitpnm1O35954 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pitpnm1O35954 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pitpnm1O35954 Gm21156-201ENSMUST00000189693 869 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Pitpnm1O35954 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pitpnm1O35954 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pitpnm1O35954 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pitpnm1O35954 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pitpnm1O35954 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pitpnm1O35954 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pitpnm1O35954 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pitpnm1O35954 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pitpnm1O35954 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pitpnm1O35954 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pitpnm1O35954 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pitpnm1O35954 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pitpnm1O35954 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Pitpnm1O35954 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pitpnm1O35954 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pitpnm1O35954 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Pitpnm1O35954 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pitpnm1O35954 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pitpnm1O35954 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pitpnm1O35954 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pitpnm1O35954 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pitpnm1O35954 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Pitpnm1O35954 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pitpnm1O35954 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Pitpnm1O35954 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pitpnm1O35954 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pitpnm1O35954 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pitpnm1O35954 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pitpnm1O35954 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pitpnm1O35954 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Pitpnm1O35954 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pitpnm1O35954 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pitpnm1O35954 AC073947.1-201ENSMUST00000216991 649 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Pitpnm1O35954 Gm11361-201ENSMUST00000223428 607 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pitpnm1O35954 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pitpnm1O35954 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pitpnm1O35954 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pitpnm1O35954 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pitpnm1O35954 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pitpnm1O35954 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pitpnm1O35954 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pitpnm1O35954 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pitpnm1O35954 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pitpnm1O35954 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pitpnm1O35954 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pitpnm1O35954 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pitpnm1O35954 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pitpnm1O35954 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pitpnm1O35954 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Pitpnm1O35954 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms