Protein–RNA interactions for Protein: O35942

Nek2, Serine/threonine-protein kinase Nek2, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek2O35942 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nek2O35942 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nek2O35942 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nek2O35942 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nek2O35942 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nek2O35942 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nek2O35942 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nek2O35942 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nek2O35942 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nek2O35942 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nek2O35942 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nek2O35942 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nek2O35942 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nek2O35942 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nek2O35942 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nek2O35942 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nek2O35942 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nek2O35942 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nek2O35942 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nek2O35942 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nek2O35942 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nek2O35942 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nek2O35942 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nek2O35942 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nek2O35942 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nek2O35942 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nek2O35942 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nek2O35942 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nek2O35942 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nek2O35942 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nek2O35942 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nek2O35942 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nek2O35942 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nek2O35942 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nek2O35942 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nek2O35942 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nek2O35942 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nek2O35942 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nek2O35942 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nek2O35942 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nek2O35942 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nek2O35942 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nek2O35942 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nek2O35942 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nek2O35942 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nek2O35942 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nek2O35942 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nek2O35942 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nek2O35942 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Nek2O35942 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nek2O35942 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nek2O35942 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nek2O35942 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nek2O35942 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Nek2O35942 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nek2O35942 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nek2O35942 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nek2O35942 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nek2O35942 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Nek2O35942 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nek2O35942 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Nek2O35942 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nek2O35942 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nek2O35942 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nek2O35942 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nek2O35942 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nek2O35942 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nek2O35942 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nek2O35942 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nek2O35942 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nek2O35942 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nek2O35942 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nek2O35942 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nek2O35942 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nek2O35942 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nek2O35942 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nek2O35942 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nek2O35942 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nek2O35942 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nek2O35942 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nek2O35942 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nek2O35942 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nek2O35942 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Nek2O35942 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nek2O35942 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nek2O35942 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nek2O35942 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nek2O35942 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nek2O35942 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nek2O35942 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nek2O35942 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nek2O35942 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nek2O35942 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nek2O35942 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Nek2O35942 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nek2O35942 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Nek2O35942 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nek2O35942 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nek2O35942 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Nek2O35942 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms