Protein–RNA interactions for Protein: O35904

Pik3cd, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit delta isoform, mousemouse

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3cdO35904 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pik3cdO35904 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pik3cdO35904 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pik3cdO35904 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pik3cdO35904 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pik3cdO35904 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pik3cdO35904 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pik3cdO35904 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pik3cdO35904 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pik3cdO35904 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pik3cdO35904 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pik3cdO35904 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pik3cdO35904 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pik3cdO35904 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pik3cdO35904 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Pik3cdO35904 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pik3cdO35904 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pik3cdO35904 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pik3cdO35904 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pik3cdO35904 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pik3cdO35904 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pik3cdO35904 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pik3cdO35904 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pik3cdO35904 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pik3cdO35904 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pik3cdO35904 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pik3cdO35904 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pik3cdO35904 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pik3cdO35904 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pik3cdO35904 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pik3cdO35904 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pik3cdO35904 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pik3cdO35904 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pik3cdO35904 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pik3cdO35904 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pik3cdO35904 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pik3cdO35904 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pik3cdO35904 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pik3cdO35904 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pik3cdO35904 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Pik3cdO35904 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pik3cdO35904 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Pik3cdO35904 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pik3cdO35904 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pik3cdO35904 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Pik3cdO35904 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pik3cdO35904 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pik3cdO35904 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pik3cdO35904 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pik3cdO35904 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pik3cdO35904 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pik3cdO35904 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pik3cdO35904 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pik3cdO35904 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pik3cdO35904 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pik3cdO35904 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pik3cdO35904 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pik3cdO35904 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pik3cdO35904 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pik3cdO35904 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pik3cdO35904 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pik3cdO35904 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pik3cdO35904 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pik3cdO35904 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pik3cdO35904 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pik3cdO35904 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pik3cdO35904 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pik3cdO35904 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pik3cdO35904 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pik3cdO35904 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pik3cdO35904 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pik3cdO35904 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pik3cdO35904 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pik3cdO35904 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pik3cdO35904 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pik3cdO35904 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pik3cdO35904 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pik3cdO35904 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pik3cdO35904 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pik3cdO35904 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pik3cdO35904 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pik3cdO35904 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Pik3cdO35904 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Pik3cdO35904 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pik3cdO35904 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pik3cdO35904 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Pik3cdO35904 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pik3cdO35904 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pik3cdO35904 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pik3cdO35904 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pik3cdO35904 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Pik3cdO35904 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pik3cdO35904 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pik3cdO35904 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pik3cdO35904 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Pik3cdO35904 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pik3cdO35904 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pik3cdO35904 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pik3cdO35904 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pik3cdO35904 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms