Protein–RNA interactions for Protein: O35738

Klf12, Krueppel-like factor 12, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf12O35738 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klf12O35738 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klf12O35738 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klf12O35738 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klf12O35738 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klf12O35738 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klf12O35738 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klf12O35738 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klf12O35738 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klf12O35738 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klf12O35738 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klf12O35738 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klf12O35738 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klf12O35738 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klf12O35738 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klf12O35738 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Klf12O35738 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klf12O35738 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klf12O35738 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klf12O35738 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klf12O35738 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klf12O35738 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Klf12O35738 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klf12O35738 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klf12O35738 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klf12O35738 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klf12O35738 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klf12O35738 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klf12O35738 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klf12O35738 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Klf12O35738 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klf12O35738 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klf12O35738 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klf12O35738 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klf12O35738 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klf12O35738 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klf12O35738 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klf12O35738 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klf12O35738 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klf12O35738 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klf12O35738 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klf12O35738 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klf12O35738 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klf12O35738 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klf12O35738 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klf12O35738 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klf12O35738 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klf12O35738 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klf12O35738 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klf12O35738 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klf12O35738 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klf12O35738 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klf12O35738 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klf12O35738 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klf12O35738 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klf12O35738 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Klf12O35738 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Klf12O35738 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Klf12O35738 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klf12O35738 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klf12O35738 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klf12O35738 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klf12O35738 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klf12O35738 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klf12O35738 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klf12O35738 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klf12O35738 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klf12O35738 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klf12O35738 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klf12O35738 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klf12O35738 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klf12O35738 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klf12O35738 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klf12O35738 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klf12O35738 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klf12O35738 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klf12O35738 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klf12O35738 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klf12O35738 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klf12O35738 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klf12O35738 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klf12O35738 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klf12O35738 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klf12O35738 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klf12O35738 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klf12O35738 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klf12O35738 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Klf12O35738 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Klf12O35738 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Klf12O35738 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Klf12O35738 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Klf12O35738 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Klf12O35738 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Klf12O35738 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Klf12O35738 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Klf12O35738 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Klf12O35738 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Klf12O35738 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Klf12O35738 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Klf12O35738 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms