Protein–RNA interactions for Protein: O35491

Clk2, Dual specificity protein kinase CLK2, mousemouse

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Length 499 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk2O35491 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Clk2O35491 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Clk2O35491 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Clk2O35491 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Clk2O35491 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Clk2O35491 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Clk2O35491 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Clk2O35491 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Clk2O35491 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Clk2O35491 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Clk2O35491 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Clk2O35491 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Clk2O35491 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Clk2O35491 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Clk2O35491 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Clk2O35491 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Clk2O35491 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Clk2O35491 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Clk2O35491 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Clk2O35491 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Clk2O35491 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Clk2O35491 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Clk2O35491 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Clk2O35491 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Clk2O35491 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Clk2O35491 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Clk2O35491 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Clk2O35491 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Clk2O35491 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Clk2O35491 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Clk2O35491 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Clk2O35491 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Clk2O35491 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Clk2O35491 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Clk2O35491 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Clk2O35491 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Clk2O35491 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Clk2O35491 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Clk2O35491 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Clk2O35491 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Clk2O35491 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Clk2O35491 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Clk2O35491 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Clk2O35491 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Clk2O35491 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Clk2O35491 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Clk2O35491 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Clk2O35491 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Clk2O35491 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Clk2O35491 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Clk2O35491 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Clk2O35491 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Clk2O35491 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Clk2O35491 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Clk2O35491 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Clk2O35491 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Clk2O35491 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Clk2O35491 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Clk2O35491 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Clk2O35491 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Clk2O35491 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Clk2O35491 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Clk2O35491 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Clk2O35491 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Clk2O35491 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Clk2O35491 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Clk2O35491 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Clk2O35491 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Clk2O35491 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Clk2O35491 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Clk2O35491 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Clk2O35491 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Clk2O35491 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Clk2O35491 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Clk2O35491 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Clk2O35491 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Clk2O35491 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Clk2O35491 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Clk2O35491 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Clk2O35491 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Clk2O35491 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Clk2O35491 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Clk2O35491 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Clk2O35491 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Clk2O35491 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Clk2O35491 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Clk2O35491 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Clk2O35491 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Clk2O35491 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Clk2O35491 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Clk2O35491 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Clk2O35491 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Clk2O35491 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Clk2O35491 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Clk2O35491 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Clk2O35491 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Clk2O35491 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Clk2O35491 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Clk2O35491 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Clk2O35491 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
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