Protein–RNA interactions for Protein: O35426

Xbp1, X-box-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xbp1O35426 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Xbp1O35426 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Xbp1O35426 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Xbp1O35426 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Xbp1O35426 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Xbp1O35426 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Xbp1O35426 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Xbp1O35426 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Xbp1O35426 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Xbp1O35426 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Xbp1O35426 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Xbp1O35426 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Xbp1O35426 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Xbp1O35426 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Xbp1O35426 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Xbp1O35426 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Xbp1O35426 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Xbp1O35426 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Xbp1O35426 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Xbp1O35426 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Xbp1O35426 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Xbp1O35426 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Xbp1O35426 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Xbp1O35426 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Xbp1O35426 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Xbp1O35426 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Xbp1O35426 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Xbp1O35426 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Xbp1O35426 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Xbp1O35426 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Xbp1O35426 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Xbp1O35426 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Xbp1O35426 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Xbp1O35426 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Xbp1O35426 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Xbp1O35426 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Xbp1O35426 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Xbp1O35426 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Xbp1O35426 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Xbp1O35426 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Xbp1O35426 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Xbp1O35426 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Xbp1O35426 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Xbp1O35426 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Xbp1O35426 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Xbp1O35426 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Xbp1O35426 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Xbp1O35426 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Xbp1O35426 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Xbp1O35426 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Xbp1O35426 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Xbp1O35426 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Xbp1O35426 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Xbp1O35426 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Xbp1O35426 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Xbp1O35426 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Xbp1O35426 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Xbp1O35426 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Xbp1O35426 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Xbp1O35426 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Xbp1O35426 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Xbp1O35426 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Xbp1O35426 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Xbp1O35426 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Xbp1O35426 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Xbp1O35426 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Xbp1O35426 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Xbp1O35426 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Xbp1O35426 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Xbp1O35426 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Xbp1O35426 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Xbp1O35426 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Xbp1O35426 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Xbp1O35426 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Xbp1O35426 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Xbp1O35426 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Xbp1O35426 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Xbp1O35426 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Xbp1O35426 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Xbp1O35426 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Xbp1O35426 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Xbp1O35426 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Xbp1O35426 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Xbp1O35426 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Xbp1O35426 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Xbp1O35426 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Xbp1O35426 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Xbp1O35426 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Xbp1O35426 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Xbp1O35426 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Xbp1O35426 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Xbp1O35426 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Xbp1O35426 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Xbp1O35426 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Xbp1O35426 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Xbp1O35426 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Xbp1O35426 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Xbp1O35426 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Xbp1O35426 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Xbp1O35426 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms