Protein–RNA interactions for Protein: O35392

Foxd2, Forkhead box protein D2, mousemouse

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Length 492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd2O35392 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Foxd2O35392 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Foxd2O35392 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Foxd2O35392 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Foxd2O35392 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Foxd2O35392 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Foxd2O35392 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Foxd2O35392 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Foxd2O35392 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Foxd2O35392 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Foxd2O35392 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Foxd2O35392 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Foxd2O35392 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Foxd2O35392 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Foxd2O35392 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Foxd2O35392 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Foxd2O35392 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Foxd2O35392 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Foxd2O35392 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Foxd2O35392 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Foxd2O35392 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Foxd2O35392 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Foxd2O35392 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Foxd2O35392 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Foxd2O35392 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Foxd2O35392 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Foxd2O35392 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Foxd2O35392 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Foxd2O35392 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Foxd2O35392 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Foxd2O35392 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Foxd2O35392 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Foxd2O35392 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Foxd2O35392 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Foxd2O35392 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Foxd2O35392 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Foxd2O35392 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Foxd2O35392 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Foxd2O35392 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Foxd2O35392 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Foxd2O35392 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Foxd2O35392 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Foxd2O35392 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Foxd2O35392 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Foxd2O35392 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Foxd2O35392 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Foxd2O35392 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Foxd2O35392 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Foxd2O35392 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Foxd2O35392 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Foxd2O35392 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Foxd2O35392 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Foxd2O35392 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Foxd2O35392 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Foxd2O35392 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Foxd2O35392 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Foxd2O35392 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Foxd2O35392 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Foxd2O35392 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Foxd2O35392 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Foxd2O35392 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Foxd2O35392 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Foxd2O35392 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Foxd2O35392 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Foxd2O35392 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Foxd2O35392 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Foxd2O35392 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Foxd2O35392 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Foxd2O35392 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Foxd2O35392 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Foxd2O35392 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Foxd2O35392 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Foxd2O35392 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Foxd2O35392 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Foxd2O35392 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Foxd2O35392 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Foxd2O35392 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Foxd2O35392 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Foxd2O35392 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Foxd2O35392 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Foxd2O35392 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Foxd2O35392 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Foxd2O35392 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Foxd2O35392 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Foxd2O35392 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Foxd2O35392 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Foxd2O35392 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Foxd2O35392 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Foxd2O35392 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Foxd2O35392 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Foxd2O35392 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Foxd2O35392 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Foxd2O35392 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Foxd2O35392 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Foxd2O35392 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Foxd2O35392 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Foxd2O35392 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Foxd2O35392 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Foxd2O35392 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Foxd2O35392 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
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