Protein–RNA interactions for Protein: O35235

Tnfsf11, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 11, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf11O35235 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfsf11O35235 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfsf11O35235 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfsf11O35235 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfsf11O35235 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfsf11O35235 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfsf11O35235 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfsf11O35235 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfsf11O35235 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfsf11O35235 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfsf11O35235 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfsf11O35235 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfsf11O35235 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfsf11O35235 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfsf11O35235 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfsf11O35235 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfsf11O35235 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfsf11O35235 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfsf11O35235 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfsf11O35235 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfsf11O35235 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfsf11O35235 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfsf11O35235 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfsf11O35235 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
Tnfsf11O35235 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Tnfsf11O35235 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfsf11O35235 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfsf11O35235 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfsf11O35235 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfsf11O35235 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfsf11O35235 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfsf11O35235 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfsf11O35235 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfsf11O35235 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfsf11O35235 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfsf11O35235 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfsf11O35235 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfsf11O35235 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfsf11O35235 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfsf11O35235 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfsf11O35235 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfsf11O35235 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfsf11O35235 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfsf11O35235 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfsf11O35235 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfsf11O35235 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfsf11O35235 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfsf11O35235 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfsf11O35235 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfsf11O35235 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfsf11O35235 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfsf11O35235 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfsf11O35235 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfsf11O35235 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfsf11O35235 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfsf11O35235 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfsf11O35235 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfsf11O35235 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfsf11O35235 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfsf11O35235 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfsf11O35235 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfsf11O35235 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfsf11O35235 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfsf11O35235 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfsf11O35235 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfsf11O35235 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfsf11O35235 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfsf11O35235 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfsf11O35235 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfsf11O35235 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfsf11O35235 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfsf11O35235 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfsf11O35235 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfsf11O35235 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfsf11O35235 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfsf11O35235 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfsf11O35235 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfsf11O35235 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfsf11O35235 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfsf11O35235 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfsf11O35235 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfsf11O35235 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfsf11O35235 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfsf11O35235 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfsf11O35235 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfsf11O35235 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfsf11O35235 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfsf11O35235 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfsf11O35235 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfsf11O35235 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfsf11O35235 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfsf11O35235 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfsf11O35235 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfsf11O35235 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfsf11O35235 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfsf11O35235 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfsf11O35235 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfsf11O35235 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfsf11O35235 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfsf11O35235 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms