Protein–RNA interactions for Protein: O35085

Arx, Homeobox protein ARX, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArxO35085 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ArxO35085 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ArxO35085 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ArxO35085 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ArxO35085 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ArxO35085 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ArxO35085 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ArxO35085 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ArxO35085 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ArxO35085 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ArxO35085 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ArxO35085 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ArxO35085 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ArxO35085 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ArxO35085 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ArxO35085 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ArxO35085 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ArxO35085 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ArxO35085 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ArxO35085 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ArxO35085 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ArxO35085 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ArxO35085 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ArxO35085 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ArxO35085 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
ArxO35085 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ArxO35085 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ArxO35085 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ArxO35085 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ArxO35085 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ArxO35085 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ArxO35085 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ArxO35085 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ArxO35085 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ArxO35085 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ArxO35085 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ArxO35085 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ArxO35085 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ArxO35085 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ArxO35085 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ArxO35085 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ArxO35085 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ArxO35085 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ArxO35085 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ArxO35085 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ArxO35085 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ArxO35085 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ArxO35085 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ArxO35085 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ArxO35085 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ArxO35085 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
ArxO35085 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
ArxO35085 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ArxO35085 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ArxO35085 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ArxO35085 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ArxO35085 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ArxO35085 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ArxO35085 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ArxO35085 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ArxO35085 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ArxO35085 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ArxO35085 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ArxO35085 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ArxO35085 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ArxO35085 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ArxO35085 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ArxO35085 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ArxO35085 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ArxO35085 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ArxO35085 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ArxO35085 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ArxO35085 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ArxO35085 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ArxO35085 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ArxO35085 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ArxO35085 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ArxO35085 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ArxO35085 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
ArxO35085 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
ArxO35085 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ArxO35085 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ArxO35085 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ArxO35085 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ArxO35085 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ArxO35085 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ArxO35085 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ArxO35085 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ArxO35085 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ArxO35085 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ArxO35085 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ArxO35085 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ArxO35085 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ArxO35085 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ArxO35085 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ArxO35085 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ArxO35085 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ArxO35085 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ArxO35085 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ArxO35085 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms