Protein–RNA interactions for Protein: O09126

Sema4d, Semaphorin-4D, mousemouse

Predictions only

Length 861 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema4dO09126 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sema4dO09126 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sema4dO09126 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sema4dO09126 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sema4dO09126 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sema4dO09126 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sema4dO09126 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sema4dO09126 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Sema4dO09126 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sema4dO09126 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sema4dO09126 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sema4dO09126 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sema4dO09126 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sema4dO09126 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sema4dO09126 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sema4dO09126 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sema4dO09126 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sema4dO09126 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sema4dO09126 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sema4dO09126 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sema4dO09126 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sema4dO09126 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sema4dO09126 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sema4dO09126 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sema4dO09126 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sema4dO09126 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Sema4dO09126 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sema4dO09126 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sema4dO09126 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sema4dO09126 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sema4dO09126 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sema4dO09126 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sema4dO09126 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sema4dO09126 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sema4dO09126 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sema4dO09126 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sema4dO09126 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sema4dO09126 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sema4dO09126 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sema4dO09126 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sema4dO09126 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sema4dO09126 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sema4dO09126 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sema4dO09126 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sema4dO09126 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sema4dO09126 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sema4dO09126 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sema4dO09126 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sema4dO09126 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sema4dO09126 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sema4dO09126 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sema4dO09126 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sema4dO09126 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sema4dO09126 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Sema4dO09126 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sema4dO09126 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sema4dO09126 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sema4dO09126 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sema4dO09126 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sema4dO09126 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sema4dO09126 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sema4dO09126 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sema4dO09126 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sema4dO09126 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sema4dO09126 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sema4dO09126 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sema4dO09126 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sema4dO09126 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sema4dO09126 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sema4dO09126 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sema4dO09126 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sema4dO09126 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sema4dO09126 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sema4dO09126 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sema4dO09126 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sema4dO09126 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sema4dO09126 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sema4dO09126 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sema4dO09126 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sema4dO09126 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Sema4dO09126 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sema4dO09126 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sema4dO09126 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sema4dO09126 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sema4dO09126 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sema4dO09126 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sema4dO09126 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sema4dO09126 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sema4dO09126 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sema4dO09126 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sema4dO09126 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sema4dO09126 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sema4dO09126 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sema4dO09126 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sema4dO09126 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sema4dO09126 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sema4dO09126 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sema4dO09126 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sema4dO09126 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sema4dO09126 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms