Protein–RNA interactions for Protein: O09116

Sprr3, Small proline-rich protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sprr3O09116 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sprr3O09116 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sprr3O09116 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sprr3O09116 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sprr3O09116 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sprr3O09116 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sprr3O09116 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sprr3O09116 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sprr3O09116 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sprr3O09116 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sprr3O09116 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sprr3O09116 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sprr3O09116 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sprr3O09116 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sprr3O09116 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sprr3O09116 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sprr3O09116 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sprr3O09116 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sprr3O09116 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sprr3O09116 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sprr3O09116 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sprr3O09116 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sprr3O09116 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sprr3O09116 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sprr3O09116 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sprr3O09116 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sprr3O09116 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sprr3O09116 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sprr3O09116 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sprr3O09116 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sprr3O09116 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sprr3O09116 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sprr3O09116 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sprr3O09116 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sprr3O09116 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sprr3O09116 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sprr3O09116 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sprr3O09116 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sprr3O09116 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sprr3O09116 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sprr3O09116 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sprr3O09116 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sprr3O09116 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sprr3O09116 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sprr3O09116 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sprr3O09116 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sprr3O09116 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sprr3O09116 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sprr3O09116 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sprr3O09116 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sprr3O09116 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sprr3O09116 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sprr3O09116 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sprr3O09116 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sprr3O09116 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sprr3O09116 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sprr3O09116 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sprr3O09116 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sprr3O09116 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sprr3O09116 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sprr3O09116 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sprr3O09116 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sprr3O09116 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sprr3O09116 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sprr3O09116 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sprr3O09116 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sprr3O09116 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sprr3O09116 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sprr3O09116 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sprr3O09116 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sprr3O09116 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sprr3O09116 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sprr3O09116 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sprr3O09116 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sprr3O09116 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sprr3O09116 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sprr3O09116 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sprr3O09116 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sprr3O09116 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sprr3O09116 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sprr3O09116 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sprr3O09116 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sprr3O09116 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sprr3O09116 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Sprr3O09116 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sprr3O09116 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sprr3O09116 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sprr3O09116 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sprr3O09116 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sprr3O09116 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sprr3O09116 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sprr3O09116 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sprr3O09116 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sprr3O09116 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sprr3O09116 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sprr3O09116 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sprr3O09116 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sprr3O09116 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sprr3O09116 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sprr3O09116 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms