Protein–RNA interactions for Protein: O09108

Lhb, Lutropin subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LhbO09108 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LhbO09108 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LhbO09108 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LhbO09108 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LhbO09108 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LhbO09108 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LhbO09108 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LhbO09108 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LhbO09108 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LhbO09108 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LhbO09108 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LhbO09108 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LhbO09108 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LhbO09108 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LhbO09108 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LhbO09108 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LhbO09108 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LhbO09108 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LhbO09108 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LhbO09108 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LhbO09108 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LhbO09108 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LhbO09108 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LhbO09108 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LhbO09108 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LhbO09108 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LhbO09108 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LhbO09108 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LhbO09108 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LhbO09108 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LhbO09108 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LhbO09108 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LhbO09108 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LhbO09108 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LhbO09108 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LhbO09108 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LhbO09108 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LhbO09108 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
LhbO09108 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
LhbO09108 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LhbO09108 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LhbO09108 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LhbO09108 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LhbO09108 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LhbO09108 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LhbO09108 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LhbO09108 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LhbO09108 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LhbO09108 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LhbO09108 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LhbO09108 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LhbO09108 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LhbO09108 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LhbO09108 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LhbO09108 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LhbO09108 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LhbO09108 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LhbO09108 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
LhbO09108 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LhbO09108 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LhbO09108 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LhbO09108 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LhbO09108 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LhbO09108 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LhbO09108 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LhbO09108 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LhbO09108 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LhbO09108 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LhbO09108 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LhbO09108 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LhbO09108 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LhbO09108 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LhbO09108 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LhbO09108 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LhbO09108 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LhbO09108 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LhbO09108 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LhbO09108 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LhbO09108 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LhbO09108 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LhbO09108 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LhbO09108 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LhbO09108 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LhbO09108 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LhbO09108 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LhbO09108 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LhbO09108 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LhbO09108 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
LhbO09108 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LhbO09108 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LhbO09108 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
LhbO09108 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LhbO09108 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LhbO09108 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LhbO09108 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LhbO09108 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LhbO09108 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LhbO09108 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LhbO09108 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LhbO09108 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms