Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

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Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
MttpO08601 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MttpO08601 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MttpO08601 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MttpO08601 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MttpO08601 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MttpO08601 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MttpO08601 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MttpO08601 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MttpO08601 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MttpO08601 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MttpO08601 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MttpO08601 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MttpO08601 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MttpO08601 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MttpO08601 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MttpO08601 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MttpO08601 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MttpO08601 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MttpO08601 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MttpO08601 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
MttpO08601 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
MttpO08601 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MttpO08601 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MttpO08601 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MttpO08601 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MttpO08601 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MttpO08601 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MttpO08601 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MttpO08601 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MttpO08601 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MttpO08601 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MttpO08601 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MttpO08601 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MttpO08601 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MttpO08601 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MttpO08601 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MttpO08601 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MttpO08601 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MttpO08601 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MttpO08601 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MttpO08601 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MttpO08601 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MttpO08601 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MttpO08601 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MttpO08601 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MttpO08601 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MttpO08601 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MttpO08601 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MttpO08601 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MttpO08601 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MttpO08601 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MttpO08601 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MttpO08601 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MttpO08601 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MttpO08601 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MttpO08601 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MttpO08601 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MttpO08601 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
MttpO08601 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MttpO08601 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MttpO08601 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MttpO08601 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MttpO08601 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MttpO08601 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MttpO08601 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MttpO08601 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MttpO08601 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MttpO08601 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MttpO08601 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MttpO08601 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MttpO08601 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MttpO08601 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MttpO08601 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MttpO08601 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MttpO08601 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MttpO08601 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MttpO08601 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MttpO08601 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MttpO08601 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MttpO08601 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MttpO08601 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MttpO08601 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MttpO08601 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MttpO08601 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MttpO08601 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MttpO08601 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
MttpO08601 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MttpO08601 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MttpO08601 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
MttpO08601 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
MttpO08601 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MttpO08601 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MttpO08601 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MttpO08601 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MttpO08601 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MttpO08601 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MttpO08601 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MttpO08601 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MttpO08601 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
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