Protein–RNA interactions for Protein: O08529

Capn2, Calpain-2 catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn2O08529 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Capn2O08529 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Capn2O08529 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Capn2O08529 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Capn2O08529 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Capn2O08529 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Capn2O08529 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Capn2O08529 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Capn2O08529 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Capn2O08529 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Capn2O08529 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Capn2O08529 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Capn2O08529 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Capn2O08529 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Capn2O08529 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Capn2O08529 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Capn2O08529 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Capn2O08529 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Capn2O08529 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Capn2O08529 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Capn2O08529 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Capn2O08529 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Capn2O08529 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Capn2O08529 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Capn2O08529 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Capn2O08529 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Capn2O08529 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Capn2O08529 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Capn2O08529 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Capn2O08529 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Capn2O08529 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Capn2O08529 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Capn2O08529 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Capn2O08529 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Capn2O08529 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Capn2O08529 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Capn2O08529 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Capn2O08529 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Capn2O08529 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Capn2O08529 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Capn2O08529 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Capn2O08529 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Capn2O08529 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Capn2O08529 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Capn2O08529 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Capn2O08529 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Capn2O08529 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Capn2O08529 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Capn2O08529 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Capn2O08529 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Capn2O08529 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Capn2O08529 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Capn2O08529 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Capn2O08529 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Capn2O08529 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Capn2O08529 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Capn2O08529 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Capn2O08529 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Capn2O08529 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Capn2O08529 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Capn2O08529 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Capn2O08529 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Capn2O08529 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Capn2O08529 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Capn2O08529 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Capn2O08529 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Capn2O08529 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Capn2O08529 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Capn2O08529 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Capn2O08529 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Capn2O08529 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Capn2O08529 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Capn2O08529 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Capn2O08529 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Capn2O08529 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Capn2O08529 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Capn2O08529 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Capn2O08529 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Capn2O08529 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Capn2O08529 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Capn2O08529 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Capn2O08529 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Capn2O08529 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Capn2O08529 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Capn2O08529 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Capn2O08529 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Capn2O08529 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Capn2O08529 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Capn2O08529 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Capn2O08529 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Capn2O08529 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Capn2O08529 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Capn2O08529 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Capn2O08529 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Capn2O08529 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Capn2O08529 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Capn2O08529 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Capn2O08529 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Capn2O08529 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Capn2O08529 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms