Protein–RNA interactions for Protein: L7N219

Gm5458, Predicted gene 5458, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5458L7N219 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm5458L7N219 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm5458L7N219 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm5458L7N219 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm5458L7N219 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm5458L7N219 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm5458L7N219 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm5458L7N219 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm5458L7N219 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm5458L7N219 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm5458L7N219 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm5458L7N219 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm5458L7N219 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm5458L7N219 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm5458L7N219 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm5458L7N219 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm5458L7N219 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm5458L7N219 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm5458L7N219 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm5458L7N219 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm5458L7N219 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm5458L7N219 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm5458L7N219 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm5458L7N219 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm5458L7N219 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm5458L7N219 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm5458L7N219 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm5458L7N219 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm5458L7N219 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm5458L7N219 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm5458L7N219 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm5458L7N219 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm5458L7N219 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm5458L7N219 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm5458L7N219 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm5458L7N219 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm5458L7N219 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm5458L7N219 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm5458L7N219 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm5458L7N219 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm5458L7N219 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm5458L7N219 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm5458L7N219 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm5458L7N219 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm5458L7N219 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm5458L7N219 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5458L7N219 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5458L7N219 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5458L7N219 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5458L7N219 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5458L7N219 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5458L7N219 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5458L7N219 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5458L7N219 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5458L7N219 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5458L7N219 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5458L7N219 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5458L7N219 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5458L7N219 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5458L7N219 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5458L7N219 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5458L7N219 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5458L7N219 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5458L7N219 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5458L7N219 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5458L7N219 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5458L7N219 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5458L7N219 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5458L7N219 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5458L7N219 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5458L7N219 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5458L7N219 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5458L7N219 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5458L7N219 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5458L7N219 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5458L7N219 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5458L7N219 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5458L7N219 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5458L7N219 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5458L7N219 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5458L7N219 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5458L7N219 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5458L7N219 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5458L7N219 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5458L7N219 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5458L7N219 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5458L7N219 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5458L7N219 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5458L7N219 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5458L7N219 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5458L7N219 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5458L7N219 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5458L7N219 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5458L7N219 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5458L7N219 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5458L7N219 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5458L7N219 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5458L7N219 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gm5458L7N219 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5458L7N219 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms