Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ23

Gm21310, Predicted gene, 21310, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21310J3QQ23 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm21310J3QQ23 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm21310J3QQ23 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm21310J3QQ23 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm21310J3QQ23 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm21310J3QQ23 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm21310J3QQ23 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm21310J3QQ23 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm21310J3QQ23 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm21310J3QQ23 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm21310J3QQ23 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm21310J3QQ23 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm21310J3QQ23 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm21310J3QQ23 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm21310J3QQ23 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm21310J3QQ23 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm21310J3QQ23 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm21310J3QQ23 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm21310J3QQ23 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm21310J3QQ23 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm21310J3QQ23 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm21310J3QQ23 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm21310J3QQ23 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm21310J3QQ23 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm21310J3QQ23 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm21310J3QQ23 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm21310J3QQ23 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm21310J3QQ23 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm21310J3QQ23 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm21310J3QQ23 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm21310J3QQ23 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm21310J3QQ23 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm21310J3QQ23 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm21310J3QQ23 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm21310J3QQ23 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm21310J3QQ23 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm21310J3QQ23 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm21310J3QQ23 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm21310J3QQ23 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm21310J3QQ23 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm21310J3QQ23 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm21310J3QQ23 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm21310J3QQ23 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm21310J3QQ23 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm21310J3QQ23 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm21310J3QQ23 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm21310J3QQ23 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm21310J3QQ23 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm21310J3QQ23 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm21310J3QQ23 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm21310J3QQ23 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm21310J3QQ23 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm21310J3QQ23 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm21310J3QQ23 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm21310J3QQ23 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm21310J3QQ23 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm21310J3QQ23 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm21310J3QQ23 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm21310J3QQ23 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm21310J3QQ23 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm21310J3QQ23 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm21310J3QQ23 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm21310J3QQ23 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm21310J3QQ23 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Gm21310J3QQ23 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm21310J3QQ23 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm21310J3QQ23 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm21310J3QQ23 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm21310J3QQ23 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm21310J3QQ23 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm21310J3QQ23 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm21310J3QQ23 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm21310J3QQ23 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm21310J3QQ23 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm21310J3QQ23 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm21310J3QQ23 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm21310J3QQ23 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm21310J3QQ23 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm21310J3QQ23 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm21310J3QQ23 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm21310J3QQ23 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm21310J3QQ23 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm21310J3QQ23 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm21310J3QQ23 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm21310J3QQ23 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm21310J3QQ23 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm21310J3QQ23 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm21310J3QQ23 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm21310J3QQ23 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm21310J3QQ23 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm21310J3QQ23 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm21310J3QQ23 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm21310J3QQ23 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm21310J3QQ23 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm21310J3QQ23 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm21310J3QQ23 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm21310J3QQ23 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm21310J3QQ23 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm21310J3QQ23 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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