Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm2056J3QQ02 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm2056J3QQ02 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm2056J3QQ02 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm2056J3QQ02 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm2056J3QQ02 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm2056J3QQ02 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm2056J3QQ02 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm2056J3QQ02 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm2056J3QQ02 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm2056J3QQ02 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm2056J3QQ02 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm2056J3QQ02 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm2056J3QQ02 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm2056J3QQ02 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm2056J3QQ02 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm2056J3QQ02 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm2056J3QQ02 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm2056J3QQ02 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm2056J3QQ02 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm2056J3QQ02 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm2056J3QQ02 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm2056J3QQ02 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm2056J3QQ02 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm2056J3QQ02 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm2056J3QQ02 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm2056J3QQ02 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm2056J3QQ02 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm2056J3QQ02 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm2056J3QQ02 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm2056J3QQ02 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm2056J3QQ02 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm2056J3QQ02 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm2056J3QQ02 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm2056J3QQ02 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm2056J3QQ02 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm2056J3QQ02 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm2056J3QQ02 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm2056J3QQ02 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm2056J3QQ02 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm2056J3QQ02 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm2056J3QQ02 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm2056J3QQ02 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm2056J3QQ02 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm2056J3QQ02 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm2056J3QQ02 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm2056J3QQ02 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm2056J3QQ02 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm2056J3QQ02 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm2056J3QQ02 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm2056J3QQ02 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm2056J3QQ02 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm2056J3QQ02 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm2056J3QQ02 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm2056J3QQ02 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm2056J3QQ02 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm2056J3QQ02 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm2056J3QQ02 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm2056J3QQ02 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm2056J3QQ02 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm2056J3QQ02 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm2056J3QQ02 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm2056J3QQ02 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm2056J3QQ02 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm2056J3QQ02 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm2056J3QQ02 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm2056J3QQ02 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm2056J3QQ02 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm2056J3QQ02 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm2056J3QQ02 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm2056J3QQ02 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm2056J3QQ02 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Gm2056J3QQ02 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm2056J3QQ02 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm2056J3QQ02 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm2056J3QQ02 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm2056J3QQ02 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm2056J3QQ02 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm2056J3QQ02 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm2056J3QQ02 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm2056J3QQ02 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm2056J3QQ02 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm2056J3QQ02 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm2056J3QQ02 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm2056J3QQ02 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm2056J3QQ02 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm2056J3QQ02 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm2056J3QQ02 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm2056J3QQ02 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm2056J3QQ02 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm2056J3QQ02 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm2056J3QQ02 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm2056J3QQ02 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm2056J3QQ02 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm2056J3QQ02 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm2056J3QQ02 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm2056J3QQ02 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm2056J3QQ02 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm2056J3QQ02 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm2056J3QQ02 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms