Protein–RNA interactions for Protein: J3QPE5

Gm5849, Predicted gene 5849, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5849J3QPE5 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm5849J3QPE5 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm5849J3QPE5 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm5849J3QPE5 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm5849J3QPE5 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm5849J3QPE5 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm5849J3QPE5 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm5849J3QPE5 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm5849J3QPE5 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm5849J3QPE5 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm5849J3QPE5 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm5849J3QPE5 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm5849J3QPE5 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm5849J3QPE5 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5849J3QPE5 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5849J3QPE5 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5849J3QPE5 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5849J3QPE5 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5849J3QPE5 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5849J3QPE5 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5849J3QPE5 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5849J3QPE5 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5849J3QPE5 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5849J3QPE5 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5849J3QPE5 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5849J3QPE5 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5849J3QPE5 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5849J3QPE5 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5849J3QPE5 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5849J3QPE5 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5849J3QPE5 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5849J3QPE5 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5849J3QPE5 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5849J3QPE5 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5849J3QPE5 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5849J3QPE5 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5849J3QPE5 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5849J3QPE5 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5849J3QPE5 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5849J3QPE5 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5849J3QPE5 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5849J3QPE5 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5849J3QPE5 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5849J3QPE5 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5849J3QPE5 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5849J3QPE5 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5849J3QPE5 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5849J3QPE5 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5849J3QPE5 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5849J3QPE5 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5849J3QPE5 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5849J3QPE5 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5849J3QPE5 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5849J3QPE5 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5849J3QPE5 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5849J3QPE5 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5849J3QPE5 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5849J3QPE5 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5849J3QPE5 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5849J3QPE5 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5849J3QPE5 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5849J3QPE5 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5849J3QPE5 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5849J3QPE5 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5849J3QPE5 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5849J3QPE5 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5849J3QPE5 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5849J3QPE5 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5849J3QPE5 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5849J3QPE5 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5849J3QPE5 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5849J3QPE5 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5849J3QPE5 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5849J3QPE5 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5849J3QPE5 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5849J3QPE5 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5849J3QPE5 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5849J3QPE5 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5849J3QPE5 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5849J3QPE5 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5849J3QPE5 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5849J3QPE5 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5849J3QPE5 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5849J3QPE5 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5849J3QPE5 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5849J3QPE5 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5849J3QPE5 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5849J3QPE5 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5849J3QPE5 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5849J3QPE5 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5849J3QPE5 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5849J3QPE5 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5849J3QPE5 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5849J3QPE5 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5849J3QPE5 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5849J3QPE5 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5849J3QPE5 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5849J3QPE5 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5849J3QPE5 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5849J3QPE5 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms