Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smim18J3QNP2 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smim18J3QNP2 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smim18J3QNP2 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smim18J3QNP2 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Smim18J3QNP2 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Smim18J3QNP2 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Smim18J3QNP2 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Smim18J3QNP2 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smim18J3QNP2 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smim18J3QNP2 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smim18J3QNP2 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smim18J3QNP2 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smim18J3QNP2 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smim18J3QNP2 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smim18J3QNP2 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smim18J3QNP2 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smim18J3QNP2 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smim18J3QNP2 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smim18J3QNP2 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smim18J3QNP2 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Smim18J3QNP2 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smim18J3QNP2 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smim18J3QNP2 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smim18J3QNP2 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smim18J3QNP2 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smim18J3QNP2 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smim18J3QNP2 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smim18J3QNP2 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smim18J3QNP2 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smim18J3QNP2 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smim18J3QNP2 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smim18J3QNP2 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smim18J3QNP2 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smim18J3QNP2 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smim18J3QNP2 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smim18J3QNP2 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smim18J3QNP2 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smim18J3QNP2 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smim18J3QNP2 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smim18J3QNP2 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smim18J3QNP2 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smim18J3QNP2 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smim18J3QNP2 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smim18J3QNP2 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smim18J3QNP2 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smim18J3QNP2 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smim18J3QNP2 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smim18J3QNP2 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smim18J3QNP2 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smim18J3QNP2 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Smim18J3QNP2 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smim18J3QNP2 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smim18J3QNP2 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smim18J3QNP2 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smim18J3QNP2 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smim18J3QNP2 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smim18J3QNP2 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smim18J3QNP2 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smim18J3QNP2 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smim18J3QNP2 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Smim18J3QNP2 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smim18J3QNP2 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Smim18J3QNP2 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smim18J3QNP2 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smim18J3QNP2 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smim18J3QNP2 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smim18J3QNP2 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smim18J3QNP2 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smim18J3QNP2 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smim18J3QNP2 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smim18J3QNP2 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Smim18J3QNP2 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Smim18J3QNP2 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smim18J3QNP2 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smim18J3QNP2 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Smim18J3QNP2 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smim18J3QNP2 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smim18J3QNP2 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smim18J3QNP2 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smim18J3QNP2 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smim18J3QNP2 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smim18J3QNP2 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smim18J3QNP2 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smim18J3QNP2 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smim18J3QNP2 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smim18J3QNP2 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smim18J3QNP2 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smim18J3QNP2 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smim18J3QNP2 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smim18J3QNP2 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smim18J3QNP2 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smim18J3QNP2 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smim18J3QNP2 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smim18J3QNP2 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smim18J3QNP2 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smim18J3QNP2 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smim18J3QNP2 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smim18J3QNP2 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smim18J3QNP2 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.4 ms