Protein–RNA interactions for Protein: J3KMU2

Gm21820, Predicted gene, 21820, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21820J3KMU2 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm21820J3KMU2 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm21820J3KMU2 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm21820J3KMU2 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm21820J3KMU2 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm21820J3KMU2 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm21820J3KMU2 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm21820J3KMU2 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm21820J3KMU2 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm21820J3KMU2 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm21820J3KMU2 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm21820J3KMU2 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm21820J3KMU2 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm21820J3KMU2 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm21820J3KMU2 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm21820J3KMU2 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm21820J3KMU2 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm21820J3KMU2 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm21820J3KMU2 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm21820J3KMU2 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm21820J3KMU2 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm21820J3KMU2 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm21820J3KMU2 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm21820J3KMU2 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm21820J3KMU2 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm21820J3KMU2 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm21820J3KMU2 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm21820J3KMU2 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm21820J3KMU2 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm21820J3KMU2 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm21820J3KMU2 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm21820J3KMU2 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm21820J3KMU2 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm21820J3KMU2 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm21820J3KMU2 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm21820J3KMU2 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm21820J3KMU2 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm21820J3KMU2 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm21820J3KMU2 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm21820J3KMU2 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm21820J3KMU2 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm21820J3KMU2 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm21820J3KMU2 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm21820J3KMU2 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm21820J3KMU2 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm21820J3KMU2 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm21820J3KMU2 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm21820J3KMU2 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm21820J3KMU2 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm21820J3KMU2 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm21820J3KMU2 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm21820J3KMU2 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm21820J3KMU2 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm21820J3KMU2 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm21820J3KMU2 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm21820J3KMU2 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm21820J3KMU2 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm21820J3KMU2 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm21820J3KMU2 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm21820J3KMU2 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm21820J3KMU2 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm21820J3KMU2 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm21820J3KMU2 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm21820J3KMU2 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm21820J3KMU2 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm21820J3KMU2 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm21820J3KMU2 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm21820J3KMU2 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm21820J3KMU2 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm21820J3KMU2 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm21820J3KMU2 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm21820J3KMU2 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm21820J3KMU2 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm21820J3KMU2 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm21820J3KMU2 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm21820J3KMU2 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm21820J3KMU2 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gm21820J3KMU2 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm21820J3KMU2 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm21820J3KMU2 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm21820J3KMU2 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm21820J3KMU2 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm21820J3KMU2 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm21820J3KMU2 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm21820J3KMU2 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm21820J3KMU2 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm21820J3KMU2 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm21820J3KMU2 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm21820J3KMU2 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm21820J3KMU2 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm21820J3KMU2 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm21820J3KMU2 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm21820J3KMU2 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm21820J3KMU2 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm21820J3KMU2 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm21820J3KMU2 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm21820J3KMU2 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm21820J3KMU2 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm21820J3KMU2 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm21820J3KMU2 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
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