Protein–RNA interactions for Protein: I3ITR1

AK157302, MCG50313, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AK157302I3ITR1 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
AK157302I3ITR1 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
AK157302I3ITR1 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
AK157302I3ITR1 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
AK157302I3ITR1 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
AK157302I3ITR1 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
AK157302I3ITR1 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
AK157302I3ITR1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
AK157302I3ITR1 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
AK157302I3ITR1 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
AK157302I3ITR1 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
AK157302I3ITR1 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
AK157302I3ITR1 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
AK157302I3ITR1 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
AK157302I3ITR1 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
AK157302I3ITR1 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
AK157302I3ITR1 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
AK157302I3ITR1 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
AK157302I3ITR1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
AK157302I3ITR1 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
AK157302I3ITR1 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
AK157302I3ITR1 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
AK157302I3ITR1 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
AK157302I3ITR1 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
AK157302I3ITR1 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
AK157302I3ITR1 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
AK157302I3ITR1 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
AK157302I3ITR1 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
AK157302I3ITR1 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
AK157302I3ITR1 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
AK157302I3ITR1 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
AK157302I3ITR1 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
AK157302I3ITR1 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
AK157302I3ITR1 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
AK157302I3ITR1 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
AK157302I3ITR1 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
AK157302I3ITR1 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
AK157302I3ITR1 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
AK157302I3ITR1 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
AK157302I3ITR1 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
AK157302I3ITR1 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
AK157302I3ITR1 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
AK157302I3ITR1 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
AK157302I3ITR1 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
AK157302I3ITR1 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
AK157302I3ITR1 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
AK157302I3ITR1 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
AK157302I3ITR1 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
AK157302I3ITR1 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
AK157302I3ITR1 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
AK157302I3ITR1 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
AK157302I3ITR1 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
AK157302I3ITR1 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
AK157302I3ITR1 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
AK157302I3ITR1 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
AK157302I3ITR1 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
AK157302I3ITR1 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
AK157302I3ITR1 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
AK157302I3ITR1 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
AK157302I3ITR1 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
AK157302I3ITR1 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
AK157302I3ITR1 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
AK157302I3ITR1 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
AK157302I3ITR1 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
AK157302I3ITR1 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
AK157302I3ITR1 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
AK157302I3ITR1 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
AK157302I3ITR1 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
AK157302I3ITR1 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
AK157302I3ITR1 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
AK157302I3ITR1 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
AK157302I3ITR1 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
AK157302I3ITR1 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
AK157302I3ITR1 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
AK157302I3ITR1 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
AK157302I3ITR1 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
AK157302I3ITR1 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
AK157302I3ITR1 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
AK157302I3ITR1 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
AK157302I3ITR1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
AK157302I3ITR1 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
AK157302I3ITR1 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
AK157302I3ITR1 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
AK157302I3ITR1 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
AK157302I3ITR1 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
AK157302I3ITR1 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
AK157302I3ITR1 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
AK157302I3ITR1 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
AK157302I3ITR1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
AK157302I3ITR1 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
AK157302I3ITR1 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
AK157302I3ITR1 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
AK157302I3ITR1 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
AK157302I3ITR1 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
AK157302I3ITR1 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
AK157302I3ITR1 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
AK157302I3ITR1 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
AK157302I3ITR1 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
AK157302I3ITR1 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
AK157302I3ITR1 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms