Protein–RNA interactions for Protein: G5E8V9

Arfip1, ADP-ribosylation factor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfip1G5E8V9 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Arfip1G5E8V9 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Arfip1G5E8V9 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Arfip1G5E8V9 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Arfip1G5E8V9 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Arfip1G5E8V9 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Arfip1G5E8V9 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Arfip1G5E8V9 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Arfip1G5E8V9 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Arfip1G5E8V9 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Arfip1G5E8V9 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Arfip1G5E8V9 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Arfip1G5E8V9 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Arfip1G5E8V9 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Arfip1G5E8V9 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Arfip1G5E8V9 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Arfip1G5E8V9 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Arfip1G5E8V9 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Arfip1G5E8V9 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Arfip1G5E8V9 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Arfip1G5E8V9 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Arfip1G5E8V9 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Arfip1G5E8V9 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Arfip1G5E8V9 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Arfip1G5E8V9 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Arfip1G5E8V9 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Arfip1G5E8V9 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Arfip1G5E8V9 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Arfip1G5E8V9 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Arfip1G5E8V9 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Arfip1G5E8V9 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Arfip1G5E8V9 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Arfip1G5E8V9 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Arfip1G5E8V9 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Arfip1G5E8V9 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Arfip1G5E8V9 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Arfip1G5E8V9 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Arfip1G5E8V9 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Arfip1G5E8V9 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Arfip1G5E8V9 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Arfip1G5E8V9 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Arfip1G5E8V9 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Arfip1G5E8V9 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Arfip1G5E8V9 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Arfip1G5E8V9 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Arfip1G5E8V9 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Arfip1G5E8V9 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Arfip1G5E8V9 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Arfip1G5E8V9 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Arfip1G5E8V9 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Arfip1G5E8V9 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Arfip1G5E8V9 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Arfip1G5E8V9 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Arfip1G5E8V9 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Arfip1G5E8V9 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Arfip1G5E8V9 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Arfip1G5E8V9 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Arfip1G5E8V9 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Arfip1G5E8V9 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Arfip1G5E8V9 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Arfip1G5E8V9 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Arfip1G5E8V9 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Arfip1G5E8V9 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Arfip1G5E8V9 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Arfip1G5E8V9 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Arfip1G5E8V9 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Arfip1G5E8V9 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Arfip1G5E8V9 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Arfip1G5E8V9 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Arfip1G5E8V9 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Arfip1G5E8V9 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Arfip1G5E8V9 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Arfip1G5E8V9 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Arfip1G5E8V9 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Arfip1G5E8V9 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Arfip1G5E8V9 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Arfip1G5E8V9 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Arfip1G5E8V9 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Arfip1G5E8V9 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Arfip1G5E8V9 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Arfip1G5E8V9 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Arfip1G5E8V9 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Arfip1G5E8V9 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Arfip1G5E8V9 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Arfip1G5E8V9 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Arfip1G5E8V9 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Arfip1G5E8V9 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Arfip1G5E8V9 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Arfip1G5E8V9 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Arfip1G5E8V9 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Arfip1G5E8V9 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Arfip1G5E8V9 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Arfip1G5E8V9 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Arfip1G5E8V9 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Arfip1G5E8V9 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Arfip1G5E8V9 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Arfip1G5E8V9 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Arfip1G5E8V9 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Arfip1G5E8V9 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Arfip1G5E8V9 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms