Protein–RNA interactions for Protein: G3X9Z4

Pcf11, Cleavage and polyadenylation factor subunit homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Predictions only

Length 1,553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcf11G3X9Z4 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Pcf11G3X9Z4 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Pcf11G3X9Z4 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
Pcf11G3X9Z4 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
Pcf11G3X9Z4 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
Pcf11G3X9Z4 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Pcf11G3X9Z4 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC30.61■■■□□ 2.49
Pcf11G3X9Z4 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Pcf11G3X9Z4 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Pcf11G3X9Z4 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Pcf11G3X9Z4 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Pcf11G3X9Z4 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Pcf11G3X9Z4 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Pcf11G3X9Z4 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Pcf11G3X9Z4 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
Pcf11G3X9Z4 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Pcf11G3X9Z4 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Pcf11G3X9Z4 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
Pcf11G3X9Z4 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Pcf11G3X9Z4 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Pcf11G3X9Z4 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Pcf11G3X9Z4 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
Pcf11G3X9Z4 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Pcf11G3X9Z4 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Pcf11G3X9Z4 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Pcf11G3X9Z4 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Pcf11G3X9Z4 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
Pcf11G3X9Z4 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Pcf11G3X9Z4 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Pcf11G3X9Z4 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Pcf11G3X9Z4 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
Pcf11G3X9Z4 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Pcf11G3X9Z4 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Pcf11G3X9Z4 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Pcf11G3X9Z4 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
Pcf11G3X9Z4 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Pcf11G3X9Z4 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Pcf11G3X9Z4 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Pcf11G3X9Z4 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Pcf11G3X9Z4 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Pcf11G3X9Z4 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Pcf11G3X9Z4 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
Pcf11G3X9Z4 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Pcf11G3X9Z4 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Pcf11G3X9Z4 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Pcf11G3X9Z4 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Pcf11G3X9Z4 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
Pcf11G3X9Z4 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Pcf11G3X9Z4 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Pcf11G3X9Z4 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Pcf11G3X9Z4 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Pcf11G3X9Z4 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Pcf11G3X9Z4 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Pcf11G3X9Z4 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Pcf11G3X9Z4 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Pcf11G3X9Z4 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Pcf11G3X9Z4 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Pcf11G3X9Z4 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Pcf11G3X9Z4 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Pcf11G3X9Z4 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Pcf11G3X9Z4 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Pcf11G3X9Z4 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Pcf11G3X9Z4 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Pcf11G3X9Z4 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
Pcf11G3X9Z4 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
Pcf11G3X9Z4 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC30.51■■■□□ 2.47
Pcf11G3X9Z4 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Pcf11G3X9Z4 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Pcf11G3X9Z4 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
Pcf11G3X9Z4 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Pcf11G3X9Z4 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Pcf11G3X9Z4 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Pcf11G3X9Z4 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Pcf11G3X9Z4 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Pcf11G3X9Z4 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Pcf11G3X9Z4 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Pcf11G3X9Z4 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Pcf11G3X9Z4 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Pcf11G3X9Z4 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Pcf11G3X9Z4 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Pcf11G3X9Z4 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Pcf11G3X9Z4 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Pcf11G3X9Z4 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Pcf11G3X9Z4 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Pcf11G3X9Z4 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Pcf11G3X9Z4 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Pcf11G3X9Z4 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Pcf11G3X9Z4 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Pcf11G3X9Z4 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Pcf11G3X9Z4 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Pcf11G3X9Z4 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Pcf11G3X9Z4 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Pcf11G3X9Z4 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Pcf11G3X9Z4 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Pcf11G3X9Z4 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Pcf11G3X9Z4 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Pcf11G3X9Z4 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Pcf11G3X9Z4 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Pcf11G3X9Z4 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Pcf11G3X9Z4 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms