Protein–RNA interactions for Protein: G3X9R7

Rnf148, RING finger protein 148, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf148G3X9R7 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rnf148G3X9R7 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rnf148G3X9R7 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rnf148G3X9R7 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rnf148G3X9R7 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rnf148G3X9R7 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rnf148G3X9R7 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rnf148G3X9R7 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rnf148G3X9R7 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rnf148G3X9R7 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rnf148G3X9R7 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rnf148G3X9R7 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rnf148G3X9R7 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rnf148G3X9R7 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rnf148G3X9R7 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rnf148G3X9R7 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rnf148G3X9R7 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rnf148G3X9R7 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rnf148G3X9R7 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rnf148G3X9R7 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rnf148G3X9R7 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rnf148G3X9R7 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rnf148G3X9R7 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rnf148G3X9R7 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rnf148G3X9R7 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rnf148G3X9R7 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rnf148G3X9R7 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rnf148G3X9R7 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rnf148G3X9R7 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rnf148G3X9R7 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rnf148G3X9R7 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rnf148G3X9R7 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rnf148G3X9R7 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rnf148G3X9R7 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rnf148G3X9R7 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Rnf148G3X9R7 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rnf148G3X9R7 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rnf148G3X9R7 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rnf148G3X9R7 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rnf148G3X9R7 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Rnf148G3X9R7 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rnf148G3X9R7 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rnf148G3X9R7 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rnf148G3X9R7 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rnf148G3X9R7 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Rnf148G3X9R7 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rnf148G3X9R7 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rnf148G3X9R7 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rnf148G3X9R7 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rnf148G3X9R7 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rnf148G3X9R7 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rnf148G3X9R7 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rnf148G3X9R7 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rnf148G3X9R7 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rnf148G3X9R7 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rnf148G3X9R7 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Rnf148G3X9R7 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Rnf148G3X9R7 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rnf148G3X9R7 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rnf148G3X9R7 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rnf148G3X9R7 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rnf148G3X9R7 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rnf148G3X9R7 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rnf148G3X9R7 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rnf148G3X9R7 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rnf148G3X9R7 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rnf148G3X9R7 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rnf148G3X9R7 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rnf148G3X9R7 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rnf148G3X9R7 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rnf148G3X9R7 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rnf148G3X9R7 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rnf148G3X9R7 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rnf148G3X9R7 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rnf148G3X9R7 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rnf148G3X9R7 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rnf148G3X9R7 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rnf148G3X9R7 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rnf148G3X9R7 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Rnf148G3X9R7 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rnf148G3X9R7 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Rnf148G3X9R7 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rnf148G3X9R7 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rnf148G3X9R7 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rnf148G3X9R7 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rnf148G3X9R7 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rnf148G3X9R7 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rnf148G3X9R7 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rnf148G3X9R7 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rnf148G3X9R7 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rnf148G3X9R7 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rnf148G3X9R7 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Rnf148G3X9R7 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rnf148G3X9R7 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Rnf148G3X9R7 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rnf148G3X9R7 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Rnf148G3X9R7 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rnf148G3X9R7 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rnf148G3X9R7 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rnf148G3X9R7 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.3 ms