Protein–RNA interactions for Protein: G3X9C2

Nccrp1, F-box only protein 50, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nccrp1G3X9C2 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nccrp1G3X9C2 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nccrp1G3X9C2 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nccrp1G3X9C2 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nccrp1G3X9C2 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nccrp1G3X9C2 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nccrp1G3X9C2 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nccrp1G3X9C2 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nccrp1G3X9C2 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nccrp1G3X9C2 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nccrp1G3X9C2 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nccrp1G3X9C2 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nccrp1G3X9C2 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nccrp1G3X9C2 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nccrp1G3X9C2 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nccrp1G3X9C2 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nccrp1G3X9C2 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nccrp1G3X9C2 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Nccrp1G3X9C2 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nccrp1G3X9C2 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nccrp1G3X9C2 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nccrp1G3X9C2 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nccrp1G3X9C2 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Nccrp1G3X9C2 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nccrp1G3X9C2 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nccrp1G3X9C2 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nccrp1G3X9C2 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nccrp1G3X9C2 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nccrp1G3X9C2 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nccrp1G3X9C2 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nccrp1G3X9C2 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nccrp1G3X9C2 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nccrp1G3X9C2 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nccrp1G3X9C2 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nccrp1G3X9C2 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nccrp1G3X9C2 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nccrp1G3X9C2 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nccrp1G3X9C2 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Nccrp1G3X9C2 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nccrp1G3X9C2 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nccrp1G3X9C2 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nccrp1G3X9C2 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nccrp1G3X9C2 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nccrp1G3X9C2 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nccrp1G3X9C2 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nccrp1G3X9C2 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Nccrp1G3X9C2 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nccrp1G3X9C2 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nccrp1G3X9C2 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nccrp1G3X9C2 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nccrp1G3X9C2 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nccrp1G3X9C2 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nccrp1G3X9C2 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nccrp1G3X9C2 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nccrp1G3X9C2 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nccrp1G3X9C2 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nccrp1G3X9C2 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nccrp1G3X9C2 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nccrp1G3X9C2 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nccrp1G3X9C2 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nccrp1G3X9C2 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nccrp1G3X9C2 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nccrp1G3X9C2 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nccrp1G3X9C2 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nccrp1G3X9C2 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nccrp1G3X9C2 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nccrp1G3X9C2 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nccrp1G3X9C2 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nccrp1G3X9C2 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nccrp1G3X9C2 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nccrp1G3X9C2 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nccrp1G3X9C2 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nccrp1G3X9C2 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nccrp1G3X9C2 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nccrp1G3X9C2 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nccrp1G3X9C2 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nccrp1G3X9C2 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nccrp1G3X9C2 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nccrp1G3X9C2 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nccrp1G3X9C2 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nccrp1G3X9C2 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Nccrp1G3X9C2 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nccrp1G3X9C2 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nccrp1G3X9C2 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nccrp1G3X9C2 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Nccrp1G3X9C2 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nccrp1G3X9C2 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nccrp1G3X9C2 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nccrp1G3X9C2 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nccrp1G3X9C2 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nccrp1G3X9C2 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nccrp1G3X9C2 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nccrp1G3X9C2 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nccrp1G3X9C2 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Nccrp1G3X9C2 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nccrp1G3X9C2 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nccrp1G3X9C2 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nccrp1G3X9C2 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nccrp1G3X9C2 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nccrp1G3X9C2 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms