Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ70

Scaper, S phase cyclin A-associated protein in the ER, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScaperF8VQ70 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ScaperF8VQ70 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ScaperF8VQ70 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ScaperF8VQ70 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ScaperF8VQ70 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ScaperF8VQ70 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ScaperF8VQ70 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ScaperF8VQ70 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ScaperF8VQ70 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ScaperF8VQ70 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ScaperF8VQ70 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ScaperF8VQ70 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ScaperF8VQ70 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ScaperF8VQ70 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ScaperF8VQ70 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ScaperF8VQ70 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ScaperF8VQ70 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ScaperF8VQ70 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ScaperF8VQ70 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ScaperF8VQ70 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ScaperF8VQ70 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ScaperF8VQ70 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ScaperF8VQ70 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ScaperF8VQ70 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ScaperF8VQ70 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ScaperF8VQ70 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ScaperF8VQ70 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ScaperF8VQ70 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ScaperF8VQ70 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ScaperF8VQ70 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ScaperF8VQ70 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ScaperF8VQ70 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ScaperF8VQ70 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ScaperF8VQ70 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ScaperF8VQ70 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ScaperF8VQ70 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ScaperF8VQ70 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ScaperF8VQ70 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ScaperF8VQ70 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ScaperF8VQ70 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ScaperF8VQ70 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ScaperF8VQ70 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ScaperF8VQ70 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ScaperF8VQ70 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ScaperF8VQ70 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ScaperF8VQ70 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ScaperF8VQ70 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ScaperF8VQ70 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ScaperF8VQ70 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ScaperF8VQ70 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ScaperF8VQ70 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ScaperF8VQ70 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ScaperF8VQ70 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ScaperF8VQ70 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ScaperF8VQ70 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ScaperF8VQ70 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ScaperF8VQ70 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ScaperF8VQ70 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ScaperF8VQ70 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ScaperF8VQ70 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
ScaperF8VQ70 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ScaperF8VQ70 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ScaperF8VQ70 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ScaperF8VQ70 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ScaperF8VQ70 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ScaperF8VQ70 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ScaperF8VQ70 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ScaperF8VQ70 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ScaperF8VQ70 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ScaperF8VQ70 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ScaperF8VQ70 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ScaperF8VQ70 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ScaperF8VQ70 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ScaperF8VQ70 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ScaperF8VQ70 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ScaperF8VQ70 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ScaperF8VQ70 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
ScaperF8VQ70 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ScaperF8VQ70 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
ScaperF8VQ70 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
ScaperF8VQ70 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ScaperF8VQ70 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ScaperF8VQ70 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ScaperF8VQ70 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ScaperF8VQ70 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ScaperF8VQ70 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
ScaperF8VQ70 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ScaperF8VQ70 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ScaperF8VQ70 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ScaperF8VQ70 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ScaperF8VQ70 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ScaperF8VQ70 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ScaperF8VQ70 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ScaperF8VQ70 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ScaperF8VQ70 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ScaperF8VQ70 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ScaperF8VQ70 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ScaperF8VQ70 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ScaperF8VQ70 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ScaperF8VQ70 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms