Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ07

5830473C10Rik, RIKEN cDNA 5830473C10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5830473C10RikF8VQ07 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
5830473C10RikF8VQ07 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
5830473C10RikF8VQ07 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
5830473C10RikF8VQ07 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
5830473C10RikF8VQ07 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
5830473C10RikF8VQ07 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
5830473C10RikF8VQ07 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
5830473C10RikF8VQ07 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
5830473C10RikF8VQ07 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
5830473C10RikF8VQ07 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
5830473C10RikF8VQ07 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
5830473C10RikF8VQ07 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
5830473C10RikF8VQ07 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
5830473C10RikF8VQ07 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
5830473C10RikF8VQ07 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
5830473C10RikF8VQ07 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
5830473C10RikF8VQ07 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
5830473C10RikF8VQ07 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
5830473C10RikF8VQ07 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
5830473C10RikF8VQ07 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
5830473C10RikF8VQ07 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
5830473C10RikF8VQ07 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
5830473C10RikF8VQ07 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
5830473C10RikF8VQ07 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
5830473C10RikF8VQ07 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
5830473C10RikF8VQ07 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
5830473C10RikF8VQ07 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
5830473C10RikF8VQ07 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
5830473C10RikF8VQ07 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
5830473C10RikF8VQ07 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
5830473C10RikF8VQ07 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
5830473C10RikF8VQ07 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
5830473C10RikF8VQ07 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
5830473C10RikF8VQ07 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
5830473C10RikF8VQ07 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
5830473C10RikF8VQ07 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
5830473C10RikF8VQ07 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
5830473C10RikF8VQ07 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
5830473C10RikF8VQ07 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
5830473C10RikF8VQ07 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
5830473C10RikF8VQ07 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
5830473C10RikF8VQ07 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
5830473C10RikF8VQ07 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
5830473C10RikF8VQ07 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
5830473C10RikF8VQ07 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
5830473C10RikF8VQ07 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
5830473C10RikF8VQ07 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
5830473C10RikF8VQ07 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
5830473C10RikF8VQ07 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
5830473C10RikF8VQ07 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
5830473C10RikF8VQ07 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
5830473C10RikF8VQ07 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
5830473C10RikF8VQ07 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
5830473C10RikF8VQ07 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
5830473C10RikF8VQ07 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
5830473C10RikF8VQ07 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
5830473C10RikF8VQ07 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
5830473C10RikF8VQ07 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
5830473C10RikF8VQ07 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
5830473C10RikF8VQ07 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
5830473C10RikF8VQ07 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
5830473C10RikF8VQ07 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
5830473C10RikF8VQ07 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
5830473C10RikF8VQ07 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
5830473C10RikF8VQ07 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
5830473C10RikF8VQ07 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
5830473C10RikF8VQ07 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
5830473C10RikF8VQ07 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
5830473C10RikF8VQ07 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
5830473C10RikF8VQ07 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
5830473C10RikF8VQ07 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
5830473C10RikF8VQ07 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
5830473C10RikF8VQ07 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
5830473C10RikF8VQ07 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
5830473C10RikF8VQ07 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
5830473C10RikF8VQ07 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
5830473C10RikF8VQ07 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
5830473C10RikF8VQ07 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
5830473C10RikF8VQ07 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
5830473C10RikF8VQ07 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
5830473C10RikF8VQ07 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
5830473C10RikF8VQ07 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
5830473C10RikF8VQ07 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
5830473C10RikF8VQ07 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
5830473C10RikF8VQ07 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
5830473C10RikF8VQ07 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
5830473C10RikF8VQ07 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
5830473C10RikF8VQ07 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
5830473C10RikF8VQ07 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
5830473C10RikF8VQ07 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
5830473C10RikF8VQ07 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
5830473C10RikF8VQ07 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
5830473C10RikF8VQ07 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
5830473C10RikF8VQ07 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
5830473C10RikF8VQ07 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
5830473C10RikF8VQ07 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
5830473C10RikF8VQ07 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
5830473C10RikF8VQ07 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
5830473C10RikF8VQ07 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
5830473C10RikF8VQ07 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.2 ms